More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0860 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  100 
 
 		 315 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  60.26 
 
 		 315 aa  368  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  59.67 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  60.4 
 
 		 315 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  51.33 
 
 		 307 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  51 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  49.51 
 
 		 312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  48 
 
 		 305 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  50 
 
 		 307 aa  292  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  48.01 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  45.98 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  45.39 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  41.69 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  59.36 
 
 		 510 aa  268  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  46.08 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  44.59 
 
 		 333 aa  266  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  40.91 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  45.1 
 
 		 311 aa  261  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  41.86 
 
 		 301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  56.52 
 
 		 512 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  41.99 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  42.33 
 
 		 301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  41.64 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  40.6 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  40 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.58 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  44.63 
 
 		 580 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 		 580 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  38.94 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  39.6 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  41.67 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  45.39 
 
 		 582 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  39.87 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 		 576 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  43.83 
 
 		 583 aa  235  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.81 
 
 		 578 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  42.81 
 
 		 578 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 578 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  42.81 
 
 		 578 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  42.81 
 
 		 578 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  42.81 
 
 		 578 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  40.88 
 
 		 667 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 578 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 578 aa  232  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 578 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  42.12 
 
 		 579 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 		 592 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  44.79 
 
 		 592 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  40.51 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  36.93 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  36.09 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 578 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 		 578 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  44.55 
 
 		 590 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 578 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 578 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 578 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  41.88 
 
 		 580 aa  225  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  43.43 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  40.59 
 
 		 322 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 585 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  43.23 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  43.72 
 
 		 651 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  41.64 
 
 		 575 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  40.72 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  42.38 
 
 		 576 aa  222  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  48.62 
 
 		 578 aa  222  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  37.92 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  36.09 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  43.56 
 
 		 590 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  39.8 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  39.61 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  37.05 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  37.42 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  43 
 
 		 594 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  42 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  39.54 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  39.6 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  37.17 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  50.47 
 
 		 593 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  39.2 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  35.4 
 
 		 327 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  42.58 
 
 		 578 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  38.41 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  47.48 
 
 		 599 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  34.98 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  40.94 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  37.01 
 
 		 580 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.42 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 589 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  41.28 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  39.24 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>