More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0918 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  100 
 
 
333 aa  679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  67.61 
 
 
320 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  66.25 
 
 
324 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  65.56 
 
 
319 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  64.59 
 
 
319 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  62.58 
 
 
308 aa  374  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  58.03 
 
 
314 aa  351  8e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  69.55 
 
 
512 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  51.26 
 
 
322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  53.72 
 
 
325 aa  325  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  51.3 
 
 
350 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  63.07 
 
 
510 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  51.61 
 
 
316 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  50.33 
 
 
319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  46.5 
 
 
307 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 
309 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 
314 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  51.16 
 
 
312 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  50.32 
 
 
322 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  55.79 
 
 
581 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  50.65 
 
 
322 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  54.55 
 
 
582 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  55.51 
 
 
585 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  44.69 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  45.98 
 
 
312 aa  272  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  44.37 
 
 
315 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  51.8 
 
 
255 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  48.53 
 
 
314 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 
321 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  53.31 
 
 
576 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 
309 aa  265  7e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  53.14 
 
 
580 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  52.74 
 
 
270 aa  265  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  49.17 
 
 
322 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  41.35 
 
 
318 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  55.16 
 
 
578 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
578 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  55.16 
 
 
578 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
578 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  55.16 
 
 
578 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
578 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  55.16 
 
 
578 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
578 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
578 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  52.07 
 
 
594 aa  261  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  52.34 
 
 
582 aa  261  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  55.51 
 
 
1106 aa  261  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  51.93 
 
 
580 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  58.6 
 
 
1171 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  50.2 
 
 
583 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  43.09 
 
 
667 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  52.12 
 
 
592 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  52.12 
 
 
592 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  54.26 
 
 
579 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  52.17 
 
 
248 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  52.59 
 
 
593 aa  258  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  42.9 
 
 
326 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  52.84 
 
 
247 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  54.26 
 
 
578 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  56.83 
 
 
599 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  51.5 
 
 
580 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  44.92 
 
 
307 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  55.61 
 
 
593 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 
578 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 
578 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 
578 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  41.69 
 
 
326 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  41.9 
 
 
323 aa  255  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  54.15 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  52.59 
 
 
575 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  52.92 
 
 
576 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
580 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  46.49 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  42.14 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  53.36 
 
 
578 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  51.67 
 
 
580 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  44.88 
 
 
315 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  54.35 
 
 
275 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  53.07 
 
 
590 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  52.26 
 
 
590 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 
311 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  55.11 
 
 
255 aa  252  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  54.24 
 
 
579 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
585 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  45.85 
 
 
316 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  44.52 
 
 
318 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 
305 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  45.98 
 
 
317 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  44.19 
 
 
307 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
322 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
307 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  43.79 
 
 
311 aa  248  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  51.06 
 
 
580 aa  249  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  50.84 
 
 
589 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  52.32 
 
 
588 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  43.85 
 
 
317 aa  245  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  44.04 
 
 
328 aa  245  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  51.29 
 
 
578 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>