More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1134 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  100 
 
 		 651 aa  1340    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  42.06 
 
 		 599 aa  432  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  41.5 
 
 		 593 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  41.09 
 
 		 593 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  41.73 
 
 		 932 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  41.95 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  42.15 
 
 		 599 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  40.83 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  41.22 
 
 		 916 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  40.14 
 
 		 912 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  41.67 
 
 		 920 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  41.64 
 
 		 912 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 583 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  40.62 
 
 		 909 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  40.61 
 
 		 583 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  36.83 
 
 		 667 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 589 aa  405  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  39.08 
 
 		 588 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  41.17 
 
 		 580 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 585 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  39.93 
 
 		 943 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  40.88 
 
 		 581 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  40.68 
 
 		 918 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  41.19 
 
 		 916 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  40.86 
 
 		 901 aa  399  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  39.36 
 
 		 582 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  39.75 
 
 		 933 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  41.07 
 
 		 936 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  41.07 
 
 		 936 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  40.11 
 
 		 594 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  38.18 
 
 		 587 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 		 930 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  39.67 
 
 		 580 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  39.02 
 
 		 580 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 		 580 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  38.84 
 
 		 580 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  39.96 
 
 		 576 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  40.35 
 
 		 579 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  40.49 
 
 		 585 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  38.66 
 
 		 924 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  38.62 
 
 		 921 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  40.55 
 
 		 929 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  40.62 
 
 		 1089 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  40.62 
 
 		 1071 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  40.25 
 
 		 1066 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  40.25 
 
 		 1082 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  39.28 
 
 		 911 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  40.62 
 
 		 1079 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  40.62 
 
 		 1071 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  39.03 
 
 		 918 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  39.9 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  37.82 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 578 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  39.28 
 
 		 1017 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  39.74 
 
 		 925 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  38.37 
 
 		 930 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  40.1 
 
 		 576 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.8 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  38.8 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  38.8 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  39.49 
 
 		 930 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 578 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 578 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 578 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 578 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  38.43 
 
 		 936 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  39.61 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  38.15 
 
 		 927 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  38.07 
 
 		 994 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  40.04 
 
 		 578 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  38.32 
 
 		 901 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  38.79 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  37.24 
 
 		 592 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  39.61 
 
 		 580 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  38.71 
 
 		 927 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 592 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  37.09 
 
 		 922 aa  362  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  37.23 
 
 		 617 aa  351  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.92 
 
 		 914 aa  348  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  35.25 
 
 		 541 aa  335  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  36.96 
 
 		 912 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  37.27 
 
 		 912 aa  325  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  36.06 
 
 		 551 aa  319  9e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  35.58 
 
 		 921 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  44.16 
 
 		 325 aa  261  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  42.51 
 
 		 319 aa  260  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  45 
 
 		 324 aa  259  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  50.95 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 319 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 		 308 aa  257  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  44.82 
 
 		 320 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 		 322 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  44.59 
 
 		 322 aa  253  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  42.12 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>