More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1304 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  58.14 
 
 
578 aa  678    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  58.14 
 
 
578 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  58.14 
 
 
580 aa  678    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 
578 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  57.82 
 
 
580 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 
578 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 
578 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  58.14 
 
 
578 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  58.14 
 
 
578 aa  678    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 
578 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  56.97 
 
 
578 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  93.21 
 
 
590 aa  1121    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  58.54 
 
 
583 aa  677    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  58.42 
 
 
580 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  57.59 
 
 
582 aa  673    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  61.86 
 
 
581 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  57.82 
 
 
580 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  57.39 
 
 
578 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  61.97 
 
 
585 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  57.27 
 
 
579 aa  659    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  58.14 
 
 
578 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  60.24 
 
 
575 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  100 
 
 
590 aa  1197    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  60.31 
 
 
582 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  58.14 
 
 
585 aa  673    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  60.67 
 
 
576 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  58.14 
 
 
578 aa  678    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  58.14 
 
 
578 aa  677    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  58.14 
 
 
578 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  58.14 
 
 
578 aa  677    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  57.69 
 
 
576 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  81.99 
 
 
594 aa  975    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  55.06 
 
 
580 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  54.88 
 
 
580 aa  631  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  53.38 
 
 
579 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  50.86 
 
 
599 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  48.55 
 
 
592 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  52.69 
 
 
578 aa  527  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
592 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  46.77 
 
 
617 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 
551 aa  514  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  46.95 
 
 
588 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  46.14 
 
 
583 aa  495  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  47.26 
 
 
593 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  47.15 
 
 
593 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
589 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  45.85 
 
 
599 aa  476  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  44.82 
 
 
587 aa  473  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 
541 aa  463  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  45.49 
 
 
512 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  46.03 
 
 
1106 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  44.19 
 
 
510 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.73 
 
 
667 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  39.66 
 
 
651 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  39.73 
 
 
933 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  40.03 
 
 
901 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  40.14 
 
 
901 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  38.67 
 
 
914 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.1 
 
 
914 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  38.29 
 
 
918 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  39.22 
 
 
912 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  40.73 
 
 
924 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.21 
 
 
913 aa  363  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  40.21 
 
 
904 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  40.03 
 
 
917 aa  362  8e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  37.57 
 
 
921 aa  362  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  38.37 
 
 
909 aa  360  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  38.7 
 
 
936 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  38.91 
 
 
936 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  38.14 
 
 
901 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  38.15 
 
 
911 aa  354  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  38.14 
 
 
920 aa  351  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  39.38 
 
 
916 aa  350  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.87 
 
 
1017 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.08 
 
 
916 aa  347  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  38.48 
 
 
916 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  37.72 
 
 
926 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  38 
 
 
908 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  37.44 
 
 
936 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  37.92 
 
 
911 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  37.92 
 
 
911 aa  340  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  37.92 
 
 
911 aa  340  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  37.94 
 
 
932 aa  340  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  37.92 
 
 
911 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  37.92 
 
 
911 aa  340  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  37.92 
 
 
911 aa  340  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  37.92 
 
 
911 aa  340  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  37.92 
 
 
911 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  36.33 
 
 
935 aa  339  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  37.75 
 
 
911 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 
919 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  37.37 
 
 
942 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  37.05 
 
 
922 aa  321  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  36.79 
 
 
928 aa  321  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  36.58 
 
 
901 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  36.64 
 
 
942 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  35.68 
 
 
927 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  35.01 
 
 
915 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  34.58 
 
 
921 aa  287  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  57.92 
 
 
1171 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>