More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0809 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  55.27 
 
 		 270 aa  287  9e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  60.63 
 
 		 314 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  55.56 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  51.68 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  55.93 
 
 		 324 aa  275  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  56.52 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  58.7 
 
 		 325 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  61.09 
 
 		 322 aa  271  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  56.76 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  54.27 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  57.92 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  55.61 
 
 		 314 aa  267  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  53.94 
 
 		 510 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  58.72 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  58.72 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  54.04 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  50.6 
 
 		 575 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  55.19 
 
 		 512 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  53.11 
 
 		 594 aa  261  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  52.42 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  54.94 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  52.42 
 
 		 593 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  51.67 
 
 		 579 aa  251  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  53.98 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  50.21 
 
 		 590 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  52.7 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  50.21 
 
 		 590 aa  247  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  49.43 
 
 		 582 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  47.27 
 
 		 580 aa  245  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  50.62 
 
 		 585 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 580 aa  245  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  48.32 
 
 		 589 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  48.77 
 
 		 582 aa  244  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  53.33 
 
 		 599 aa  244  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  48.45 
 
 		 581 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 583 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  52.51 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  49.1 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  48.96 
 
 		 578 aa  240  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 578 aa  239  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  46.91 
 
 		 578 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 578 aa  239  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 578 aa  239  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 578 aa  239  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 578 aa  239  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.91 
 
 		 578 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  46.91 
 
 		 578 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 578 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 350 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  48.95 
 
 		 580 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  53.02 
 
 		 316 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  49.18 
 
 		 576 aa  238  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  47.54 
 
 		 579 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  48.99 
 
 		 593 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  44.36 
 
 		 906 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  53.02 
 
 		 651 aa  236  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  47.6 
 
 		 308 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  47.28 
 
 		 576 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  44.98 
 
 		 580 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  53.14 
 
 		 578 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  47.6 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  45.9 
 
 		 583 aa  234  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 585 aa  234  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 578 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 578 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  47.45 
 
 		 599 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 578 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 578 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  44.44 
 
 		 906 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  44.76 
 
 		 580 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  46.5 
 
 		 580 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 1171 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  49.07 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  53.95 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  45.9 
 
 		 578 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.06 
 
 		 906 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  48.58 
 
 		 912 aa  232  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 308 aa  231  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  51.39 
 
 		 335 aa  231  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  46.75 
 
 		 943 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  47.15 
 
 		 925 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 		 541 aa  231  9e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.91 
 
 		 907 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  45.85 
 
 		 916 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  46.91 
 
 		 918 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  49.79 
 
 		 917 aa  228  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  49.37 
 
 		 930 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  47.84 
 
 		 927 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  47.11 
 
 		 1017 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  46.15 
 
 		 617 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  47.5 
 
 		 928 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  47.75 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  45.38 
 
 		 904 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.5 
 
 		 913 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  48.68 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  47.28 
 
 		 912 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>