More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00600 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  57.95 
 
 
589 aa  701    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  71.03 
 
 
593 aa  791    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  64.24 
 
 
599 aa  719    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  100 
 
 
593 aa  1169    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  60.22 
 
 
583 aa  699    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  58.04 
 
 
588 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  57.67 
 
 
578 aa  568  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  55.06 
 
 
599 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  50.43 
 
 
587 aa  552  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.53 
 
 
578 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  48.53 
 
 
578 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  52.74 
 
 
582 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  51.05 
 
 
581 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  48.35 
 
 
578 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  49.05 
 
 
578 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
578 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
578 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
578 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
578 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  49.05 
 
 
578 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  48.35 
 
 
578 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 
578 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  49.05 
 
 
578 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
578 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  49.05 
 
 
578 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  50.9 
 
 
583 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  49.77 
 
 
1106 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  51.74 
 
 
585 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  49.19 
 
 
579 aa  522  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 
580 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  48.53 
 
 
576 aa  518  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  48 
 
 
580 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  49.58 
 
 
578 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  49.04 
 
 
580 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  51.55 
 
 
592 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  51.55 
 
 
592 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
585 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  47.4 
 
 
575 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  50.09 
 
 
576 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  49.75 
 
 
580 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  50 
 
 
582 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  44.2 
 
 
580 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  48.19 
 
 
594 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  43.86 
 
 
580 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  47.21 
 
 
590 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  46.75 
 
 
590 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  49.05 
 
 
579 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  46.42 
 
 
617 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  41.09 
 
 
651 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 
551 aa  409  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  41.81 
 
 
510 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  40.07 
 
 
667 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  37.74 
 
 
541 aa  385  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  40.03 
 
 
918 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  40.07 
 
 
909 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  39.68 
 
 
917 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  37.87 
 
 
922 aa  365  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  39.37 
 
 
921 aa  364  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  38.84 
 
 
925 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  39.75 
 
 
912 aa  362  9e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  40.18 
 
 
933 aa  362  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  40.98 
 
 
904 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  40.56 
 
 
914 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  37.83 
 
 
926 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  40.53 
 
 
912 aa  355  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  40 
 
 
901 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  39.39 
 
 
936 aa  351  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  39.39 
 
 
936 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  37.65 
 
 
922 aa  349  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  39.75 
 
 
912 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  39.73 
 
 
927 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  39.47 
 
 
912 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  40.04 
 
 
936 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  38.94 
 
 
911 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  37.39 
 
 
942 aa  331  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  36.97 
 
 
932 aa  314  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  37.08 
 
 
908 aa  299  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  60.16 
 
 
1171 aa  291  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  58.11 
 
 
312 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  48.85 
 
 
512 aa  260  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  52.42 
 
 
257 aa  256  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  52.23 
 
 
333 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  48.59 
 
 
324 aa  250  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  56.95 
 
 
314 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  59.81 
 
 
322 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  47.41 
 
 
247 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  52.75 
 
 
320 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  50 
 
 
248 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  51.75 
 
 
319 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  58.6 
 
 
322 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  59.07 
 
 
322 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  53.88 
 
 
314 aa  245  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  54.3 
 
 
319 aa  243  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
319 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  52.44 
 
 
325 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  45.86 
 
 
943 aa  239  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  50 
 
 
308 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  52.02 
 
 
316 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  54.55 
 
 
322 aa  238  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  44.86 
 
 
270 aa  238  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>