More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1019 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  57.77 
 
 
578 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  57.77 
 
 
578 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 
578 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  58.88 
 
 
583 aa  677    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  60.41 
 
 
581 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  61.8 
 
 
585 aa  666    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  57.74 
 
 
576 aa  687    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  57.77 
 
 
578 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  57.77 
 
 
578 aa  683    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  80.79 
 
 
594 aa  962    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  55.24 
 
 
580 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  58.1 
 
 
578 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  55.24 
 
 
580 aa  635    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  56.99 
 
 
578 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 
578 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  58.57 
 
 
580 aa  678    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  57.77 
 
 
578 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  57.89 
 
 
580 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  93.21 
 
 
590 aa  1102    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  59.16 
 
 
585 aa  674    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  58.59 
 
 
582 aa  677    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 
578 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 
578 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  58.17 
 
 
580 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  57.77 
 
 
578 aa  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  100 
 
 
590 aa  1195    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  59.76 
 
 
575 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  57.77 
 
 
578 aa  682    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  57.24 
 
 
579 aa  665    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  60.39 
 
 
576 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  58.17 
 
 
580 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  61.02 
 
 
582 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 
578 aa  683    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  57.77 
 
 
578 aa  684    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  53.4 
 
 
579 aa  557  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  51.72 
 
 
599 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
592 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  46.88 
 
 
617 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  52.13 
 
 
578 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  48.1 
 
 
592 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 
551 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  46.67 
 
 
588 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
583 aa  494  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  47.27 
 
 
593 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  42.81 
 
 
589 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  46.75 
 
 
593 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  44.64 
 
 
587 aa  473  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  47 
 
 
599 aa  473  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  46.69 
 
 
1106 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 
541 aa  455  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  45.13 
 
 
512 aa  452  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  44.37 
 
 
510 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.38 
 
 
667 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  39.61 
 
 
651 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  40 
 
 
917 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  38.78 
 
 
915 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  39.82 
 
 
904 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  38.41 
 
 
909 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.28 
 
 
914 aa  356  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  37.59 
 
 
921 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  38.75 
 
 
918 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  37.96 
 
 
920 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.59 
 
 
913 aa  350  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.09 
 
 
916 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  38.14 
 
 
901 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  36.79 
 
 
932 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  38.39 
 
 
901 aa  342  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  38 
 
 
908 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  37.26 
 
 
911 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  37.26 
 
 
911 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  38.28 
 
 
994 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  37.09 
 
 
911 aa  326  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  37.26 
 
 
911 aa  322  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  37.26 
 
 
911 aa  322  9.000000000000001e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  37.26 
 
 
911 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  37.26 
 
 
911 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  37.26 
 
 
911 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  37.26 
 
 
911 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  37.7 
 
 
942 aa  321  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  36.28 
 
 
928 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  36.49 
 
 
936 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  37.13 
 
 
942 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  35.83 
 
 
936 aa  287  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  57.92 
 
 
1171 aa  282  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  54.5 
 
 
320 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  54.46 
 
 
325 aa  253  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  48.01 
 
 
916 aa  253  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  52.4 
 
 
324 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  46.77 
 
 
247 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  45.75 
 
 
248 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 
308 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  54.42 
 
 
314 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 
257 aa  247  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  53.07 
 
 
333 aa  247  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  54.46 
 
 
322 aa  247  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  52.04 
 
 
314 aa  246  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  46.4 
 
 
270 aa  245  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  51.11 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  54.42 
 
 
322 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  51.83 
 
 
319 aa  243  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>