More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1355 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  100 
 
 
315 aa  626  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  53.33 
 
 
322 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  54.46 
 
 
335 aa  345  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  56.63 
 
 
346 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  57.05 
 
 
346 aa  342  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  57.24 
 
 
346 aa  341  9e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 
327 aa  341  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  56.62 
 
 
317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 
323 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  55.26 
 
 
318 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  55.26 
 
 
318 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  55.26 
 
 
318 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  55.26 
 
 
318 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  52.06 
 
 
323 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  51.98 
 
 
340 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.39 
 
 
322 aa  328  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.41 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  51.47 
 
 
308 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  52.3 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  50.81 
 
 
308 aa  317  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  46.95 
 
 
320 aa  293  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  48.69 
 
 
314 aa  287  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  50.48 
 
 
322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  44.73 
 
 
324 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  51.68 
 
 
316 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  49.35 
 
 
325 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  47.4 
 
 
314 aa  276  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  47 
 
 
326 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  49.49 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  47.51 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  46.98 
 
 
326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  48 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  49 
 
 
313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  49.67 
 
 
304 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  49.5 
 
 
328 aa  272  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  44.52 
 
 
307 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  46.43 
 
 
312 aa  269  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  46.15 
 
 
316 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  49.34 
 
 
317 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  45.03 
 
 
319 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.32 
 
 
311 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  48.68 
 
 
318 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  45.25 
 
 
333 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  47.73 
 
 
319 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
319 aa  265  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  48.99 
 
 
350 aa  265  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  48.32 
 
 
328 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 
305 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  45.28 
 
 
315 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
309 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  49.17 
 
 
311 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  55.96 
 
 
512 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  47.02 
 
 
314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  47.12 
 
 
323 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  46.36 
 
 
323 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  46.38 
 
 
354 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  47.16 
 
 
312 aa  255  8e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  46.1 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  47.99 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  50.34 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  46.89 
 
 
317 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  46.06 
 
 
331 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 
315 aa  249  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  54.59 
 
 
510 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  42.81 
 
 
318 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  44.37 
 
 
308 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  43.91 
 
 
307 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  42.24 
 
 
305 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  45.03 
 
 
307 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  45.95 
 
 
311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  48.67 
 
 
291 aa  244  9e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  44.67 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  43.71 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  47.57 
 
 
331 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  44.92 
 
 
311 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  46.33 
 
 
317 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  50.44 
 
 
582 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  44.52 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.16 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  49.05 
 
 
691 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  53.95 
 
 
257 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  41.04 
 
 
307 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  52.73 
 
 
594 aa  232  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.81 
 
 
667 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  46.32 
 
 
580 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  49.12 
 
 
576 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  52.07 
 
 
593 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  45.18 
 
 
310 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  45 
 
 
310 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  40.51 
 
 
315 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  50.91 
 
 
590 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  43.48 
 
 
248 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  42.92 
 
 
270 aa  229  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  47.15 
 
 
906 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  45 
 
 
310 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  44.11 
 
 
315 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  45.89 
 
 
580 aa  228  8e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  45.31 
 
 
314 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  47.73 
 
 
255 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>