More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1293 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
350 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  74.11 
 
 
316 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  70.26 
 
 
309 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  60.97 
 
 
319 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  53.42 
 
 
314 aa  332  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  51.47 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  54.36 
 
 
308 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  53.16 
 
 
322 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  51.64 
 
 
320 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  53.72 
 
 
325 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  52.1 
 
 
333 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  47.91 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  50.49 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  55.37 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  49.5 
 
 
307 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  48.68 
 
 
319 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  57.39 
 
 
510 aa  288  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  59.56 
 
 
512 aa  288  8e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  50.84 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  45.63 
 
 
667 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  51.1 
 
 
255 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  46.94 
 
 
311 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  47.19 
 
 
328 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  54.69 
 
 
582 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  44.06 
 
 
323 aa  258  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 
308 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
309 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  46.03 
 
 
316 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 
312 aa  257  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  43.73 
 
 
323 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  45.54 
 
 
312 aa  256  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  46.62 
 
 
313 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  47.66 
 
 
248 aa  255  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  47.19 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  48.52 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  45.92 
 
 
311 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  47.39 
 
 
311 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 
322 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  41.82 
 
 
318 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  43.93 
 
 
323 aa  252  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  39.7 
 
 
335 aa  252  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  53.81 
 
 
594 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  42.38 
 
 
305 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  43.19 
 
 
322 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  41.12 
 
 
326 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  48.69 
 
 
314 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  46.86 
 
 
318 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  49.55 
 
 
270 aa  250  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.05 
 
 
311 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  50.17 
 
 
322 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  45.86 
 
 
317 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  47.71 
 
 
317 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  42.99 
 
 
354 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  50.43 
 
 
580 aa  249  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  45.28 
 
 
323 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  45.14 
 
 
323 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  50.43 
 
 
580 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.58 
 
 
308 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
305 aa  246  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  42.32 
 
 
327 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  51.04 
 
 
575 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  41.54 
 
 
340 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  43.52 
 
 
346 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  41.35 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  49.56 
 
 
247 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  47.76 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  44.22 
 
 
317 aa  246  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.3 
 
 
322 aa  245  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
307 aa  245  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  44.37 
 
 
322 aa  245  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 
315 aa  245  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  53.18 
 
 
255 aa  245  9e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  44.78 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  52.82 
 
 
581 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  53.67 
 
 
590 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  50.78 
 
 
576 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  44.55 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  52.68 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  53.21 
 
 
590 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  45.3 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  53.33 
 
 
580 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  45.3 
 
 
346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  42.9 
 
 
321 aa  242  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  44.37 
 
 
308 aa  242  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  46.94 
 
 
582 aa  242  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  41.53 
 
 
307 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  51.42 
 
 
585 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  50 
 
 
691 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  44.97 
 
 
318 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  44.97 
 
 
318 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  44.97 
 
 
318 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 
257 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
578 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  48.64 
 
 
578 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.88 
 
 
308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
578 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
578 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
578 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  48.88 
 
 
583 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  43.77 
 
 
313 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>