More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1795 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  100 
 
 
578 aa  1131    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  62.35 
 
 
599 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  56.44 
 
 
592 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  56.44 
 
 
592 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  58.15 
 
 
593 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  56.75 
 
 
581 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  55.81 
 
 
588 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  57.34 
 
 
585 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  56.42 
 
 
576 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  54.02 
 
 
578 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  54.02 
 
 
578 aa  594  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  54.02 
 
 
578 aa  594  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  54.02 
 
 
578 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  54.02 
 
 
578 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  53.67 
 
 
578 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  54.02 
 
 
578 aa  594  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  54.02 
 
 
578 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  54.02 
 
 
578 aa  594  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  52.55 
 
 
580 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  58.63 
 
 
593 aa  591  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  52.55 
 
 
580 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  52.85 
 
 
579 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 
578 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 
578 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 
578 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 
578 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 
578 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  55.19 
 
 
582 aa  585  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  53.45 
 
 
582 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  52.75 
 
 
583 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  55.04 
 
 
580 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  53.23 
 
 
590 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  52.45 
 
 
576 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  53.82 
 
 
575 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  54.99 
 
 
579 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  51.03 
 
 
585 aa  561  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  53.02 
 
 
594 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  50.7 
 
 
580 aa  557  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  52.66 
 
 
590 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  52.68 
 
 
587 aa  553  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  55.21 
 
 
1106 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  49.64 
 
 
589 aa  549  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  50.54 
 
 
583 aa  551  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  55.18 
 
 
599 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  52.67 
 
 
578 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  48.53 
 
 
580 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  48.35 
 
 
580 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  47.07 
 
 
617 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  46.17 
 
 
512 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  46.45 
 
 
510 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  42.76 
 
 
651 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
551 aa  434  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 
541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  43.68 
 
 
901 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  41.18 
 
 
920 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  41.71 
 
 
915 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  45.57 
 
 
901 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  45.39 
 
 
901 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  41.96 
 
 
667 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  42.83 
 
 
912 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  42.55 
 
 
904 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  43.61 
 
 
911 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  39.73 
 
 
918 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  42.81 
 
 
912 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  42.31 
 
 
912 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.65 
 
 
914 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  40.93 
 
 
921 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  42.73 
 
 
924 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  41.2 
 
 
930 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  39.75 
 
 
911 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  39.75 
 
 
911 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.89 
 
 
906 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  39.75 
 
 
911 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  39.75 
 
 
911 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  39.06 
 
 
906 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  39.61 
 
 
911 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  39.75 
 
 
911 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  39.61 
 
 
911 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  39.89 
 
 
911 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  39.69 
 
 
930 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  39.57 
 
 
911 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  40.07 
 
 
919 aa  365  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  41.47 
 
 
916 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  41.31 
 
 
927 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  39.14 
 
 
913 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  39.31 
 
 
913 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  39.31 
 
 
913 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  39.31 
 
 
913 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  40.24 
 
 
909 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  41.13 
 
 
908 aa  356  6.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  39.86 
 
 
914 aa  348  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  39.93 
 
 
912 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  37.72 
 
 
906 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  40.75 
 
 
942 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  40.42 
 
 
929 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  40.48 
 
 
936 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  40.31 
 
 
912 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  38.94 
 
 
936 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  38.9 
 
 
936 aa  331  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  38.65 
 
 
922 aa  320  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>