More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1588 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  100 
 
 
307 aa  634    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  61.11 
 
 
314 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  49.84 
 
 
320 aa  321  9.000000000000001e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  50.5 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  48.87 
 
 
324 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  50.68 
 
 
319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  51.35 
 
 
319 aa  308  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  48.33 
 
 
314 aa  305  8.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  50.17 
 
 
325 aa  302  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  49.35 
 
 
316 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  48.83 
 
 
308 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  49.5 
 
 
350 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  46.08 
 
 
333 aa  298  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  46.84 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  57.66 
 
 
510 aa  271  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  45.48 
 
 
312 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  56.62 
 
 
512 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  44.52 
 
 
315 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.9 
 
 
311 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  44.52 
 
 
313 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  41.75 
 
 
314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  42.33 
 
 
321 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  44.41 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  41.83 
 
 
305 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  41.72 
 
 
326 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  44.44 
 
 
311 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  41.86 
 
 
326 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  43.51 
 
 
322 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  43.96 
 
 
322 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  41.12 
 
 
311 aa  248  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  248  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  50.89 
 
 
594 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  43.09 
 
 
335 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  46.98 
 
 
248 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  42.52 
 
 
314 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  44.82 
 
 
346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  44.82 
 
 
346 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  41.47 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
307 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 
315 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  39.22 
 
 
311 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  41.25 
 
 
308 aa  244  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  43.61 
 
 
318 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  43.61 
 
 
318 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  48.7 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  42.76 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  51.11 
 
 
590 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  40.53 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  43.61 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  44.97 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  41.64 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  42.3 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  43.61 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  42.77 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  42.72 
 
 
317 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  39.6 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  49.78 
 
 
580 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 
322 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  41.78 
 
 
312 aa  242  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  51.58 
 
 
590 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  49.1 
 
 
257 aa  242  7e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  47.77 
 
 
582 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  42.72 
 
 
316 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  42.33 
 
 
318 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  48.9 
 
 
580 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.5 
 
 
322 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  49.1 
 
 
585 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  41.21 
 
 
327 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  46.96 
 
 
247 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  39.23 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  41.08 
 
 
354 aa  235  9e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  40.65 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  48.65 
 
 
581 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
580 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  38.8 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  47.3 
 
 
580 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  50.23 
 
 
578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  49.1 
 
 
582 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  47.3 
 
 
583 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  50.23 
 
 
575 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  49.1 
 
 
576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.26 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.49 
 
 
308 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  38.26 
 
 
323 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  50 
 
 
580 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  42.09 
 
 
311 aa  232  5e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  41.29 
 
 
308 aa  232  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  40 
 
 
317 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  39.87 
 
 
318 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  41.02 
 
 
302 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 
576 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  39.74 
 
 
308 aa  229  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  40.67 
 
 
323 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  38.41 
 
 
667 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  36.09 
 
 
315 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  47.71 
 
 
255 aa  229  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  48.21 
 
 
593 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>