More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3276 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  100 
 
 		 319 aa  648    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  93.73 
 
 		 319 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  67 
 
 		 324 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  67.66 
 
 		 320 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  65.66 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  60.4 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  72.44 
 
 		 512 aa  347  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  55.02 
 
 		 314 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  71.56 
 
 		 510 aa  334  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  51.85 
 
 		 325 aa  308  8e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  51.19 
 
 		 309 aa  308  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  51.35 
 
 		 307 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  50.5 
 
 		 322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  50.67 
 
 		 316 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  51.68 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  48.05 
 
 		 319 aa  296  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 		 350 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  46.42 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  56.22 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  44.23 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  51.16 
 
 		 322 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  50.83 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  50.5 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  48.84 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  44.59 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  47.84 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  49.16 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  54.71 
 
 		 248 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  44.74 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  45.33 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  44.81 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  42.09 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  45.12 
 
 		 315 aa  265  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  44.82 
 
 		 308 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  44.34 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  41.27 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  42.81 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  45.82 
 
 		 308 aa  261  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  44.86 
 
 		 323 aa  261  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  42.16 
 
 		 667 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  46 
 
 		 317 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  44.7 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 		 305 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  45.73 
 
 		 316 aa  258  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  52.94 
 
 		 247 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  44.3 
 
 		 651 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  53.53 
 
 		 1171 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  46.15 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  52.59 
 
 		 581 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  55.09 
 
 		 580 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  44.52 
 
 		 307 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 		 312 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  55.61 
 
 		 582 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  52.49 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  53.28 
 
 		 255 aa  255  8e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  45.64 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  51.21 
 
 		 257 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  55.14 
 
 		 585 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  55.76 
 
 		 578 aa  252  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  53.64 
 
 		 594 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 307 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  53.39 
 
 		 576 aa  251  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  55.09 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  43.52 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 		 578 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 		 578 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  46.23 
 
 		 302 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 		 578 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 		 578 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 		 578 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  45.21 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  50.88 
 
 		 575 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  51.53 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  51.53 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  51.53 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  51.53 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  51.13 
 
 		 582 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  50.89 
 
 		 579 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 580 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  50.67 
 
 		 580 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  50.66 
 
 		 579 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  43 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  50.64 
 
 		 593 aa  242  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  51.13 
 
 		 583 aa  242  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  43.64 
 
 		 313 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  42.81 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.69 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  49.12 
 
 		 576 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  51.13 
 
 		 585 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  41.42 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>