More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1606 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
315 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  75.17 
 
 
314 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  71.52 
 
 
315 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  60.26 
 
 
315 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  54.52 
 
 
312 aa  314  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  51 
 
 
305 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  50.33 
 
 
307 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  50.65 
 
 
308 aa  288  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  48.7 
 
 
315 aa  286  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  52.33 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  49.5 
 
 
307 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  45.1 
 
 
317 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  45.7 
 
 
301 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  47.39 
 
 
311 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  45.63 
 
 
311 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  42.05 
 
 
301 aa  255  6e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  41.46 
 
 
322 aa  254  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  53.15 
 
 
512 aa  255  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  41.83 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  43.19 
 
 
314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  57.99 
 
 
510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  42.3 
 
 
320 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  40.26 
 
 
335 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  42.11 
 
 
324 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  41.97 
 
 
319 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  44.04 
 
 
310 aa  249  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  43.93 
 
 
315 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  41.97 
 
 
312 aa  249  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  42.48 
 
 
325 aa  248  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  42.62 
 
 
299 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  42.35 
 
 
307 aa  245  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  44.93 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.51 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  38.22 
 
 
322 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
323 aa  238  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  48.5 
 
 
1171 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.95 
 
 
305 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  42.43 
 
 
575 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  42.48 
 
 
354 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  39.94 
 
 
319 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  43.31 
 
 
592 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  43.31 
 
 
592 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  44.34 
 
 
1106 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  37.5 
 
 
323 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 
340 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 
350 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 
308 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  37.99 
 
 
327 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  38.76 
 
 
313 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.87 
 
 
667 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  38.41 
 
 
307 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  43.73 
 
 
578 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.48 
 
 
308 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.23 
 
 
316 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  37.25 
 
 
308 aa  222  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 
309 aa  222  7e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  42.48 
 
 
590 aa  222  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  38.49 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  43.18 
 
 
578 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  49.13 
 
 
594 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  38.61 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 
322 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 
309 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  39.54 
 
 
323 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  44.59 
 
 
270 aa  219  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  39.22 
 
 
323 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  44.19 
 
 
310 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  42.67 
 
 
590 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
578 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  38.41 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.1 
 
 
578 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  40.86 
 
 
321 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
578 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
578 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  41.1 
 
 
578 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  43.91 
 
 
317 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
578 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
578 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
578 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  44.19 
 
 
310 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
578 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
578 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
578 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
578 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  41.1 
 
 
578 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  40.37 
 
 
599 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  38.94 
 
 
588 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
578 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  39.4 
 
 
326 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 
315 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  41.64 
 
 
583 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 
311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  40.58 
 
 
576 aa  215  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  38.03 
 
 
318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  36.27 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  38.03 
 
 
318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  38.03 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>