More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0256 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  100 
 
 
291 aa  580  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  79.3 
 
 
307 aa  461  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  44.67 
 
 
324 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  43.52 
 
 
319 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 
320 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  44 
 
 
319 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  48.67 
 
 
315 aa  244  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  46.44 
 
 
304 aa  241  9e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  44.15 
 
 
325 aa  241  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  43.23 
 
 
314 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  44.78 
 
 
354 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  41.41 
 
 
318 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  43.83 
 
 
322 aa  235  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  41.95 
 
 
335 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  44.19 
 
 
319 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  50.68 
 
 
512 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  45.15 
 
 
270 aa  229  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  46.82 
 
 
248 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
312 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
315 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  50.22 
 
 
510 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
309 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  41.44 
 
 
316 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  38.44 
 
 
307 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  46.54 
 
 
247 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 
312 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 
309 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  44.26 
 
 
302 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  40.97 
 
 
323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  42.81 
 
 
305 aa  222  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  41.61 
 
 
314 aa  222  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  41.16 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  40.89 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  41.75 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  41.3 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  42.99 
 
 
312 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  42.52 
 
 
328 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  44.77 
 
 
311 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.8 
 
 
316 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  48.15 
 
 
326 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  40.59 
 
 
326 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  44.04 
 
 
311 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 
311 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  40.59 
 
 
317 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  41.14 
 
 
321 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  37.92 
 
 
308 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.25 
 
 
308 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  40.33 
 
 
311 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  41.5 
 
 
314 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 
350 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  42.42 
 
 
322 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  42.66 
 
 
322 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  40.46 
 
 
333 aa  214  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  39.46 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  40.86 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  41.95 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  42.66 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  47.79 
 
 
594 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  40.33 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
308 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  36.39 
 
 
322 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  46.12 
 
 
255 aa  209  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  44.29 
 
 
255 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.13 
 
 
322 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  37.95 
 
 
327 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  43.33 
 
 
578 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  40.52 
 
 
307 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
307 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  41.29 
 
 
331 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 
257 aa  205  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.33 
 
 
314 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  42.01 
 
 
308 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  49.55 
 
 
314 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  44.19 
 
 
691 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  44.49 
 
 
585 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  37.71 
 
 
301 aa  203  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
579 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  43.84 
 
 
575 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  41.14 
 
 
331 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  45.45 
 
 
275 aa  201  8e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.4 
 
 
334 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 
340 aa  201  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  39.55 
 
 
323 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  34.56 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  37.92 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.68 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  38.64 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  44.81 
 
 
593 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  38.64 
 
 
313 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 
315 aa  198  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  40.92 
 
 
316 aa  198  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  43.53 
 
 
581 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.64 
 
 
327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  46.79 
 
 
593 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
578 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  41.1 
 
 
578 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  41.1 
 
 
578 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
578 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>