More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4664 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  100 
 
 
318 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  64.69 
 
 
328 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  65.4 
 
 
317 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  64.1 
 
 
313 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  64.94 
 
 
311 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.47 
 
 
311 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  64.8 
 
 
314 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  61.92 
 
 
316 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  59.74 
 
 
318 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  57.67 
 
 
326 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  61.06 
 
 
305 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  59.02 
 
 
323 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  57.48 
 
 
312 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  61.23 
 
 
331 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  59.6 
 
 
326 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  58.94 
 
 
321 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
309 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  63.04 
 
 
316 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  63.25 
 
 
302 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  59.34 
 
 
322 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  57.62 
 
 
315 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  59.6 
 
 
328 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  57.23 
 
 
323 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  57.23 
 
 
323 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  59.87 
 
 
331 aa  358  9e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  59.27 
 
 
304 aa  352  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  57.14 
 
 
317 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  56.11 
 
 
308 aa  333  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  54.9 
 
 
354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  58.04 
 
 
691 aa  318  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  43.24 
 
 
308 aa  278  7e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  42.91 
 
 
308 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  47.99 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  47.08 
 
 
346 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  48.53 
 
 
314 aa  269  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  47.96 
 
 
346 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  44.66 
 
 
335 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  48.68 
 
 
315 aa  266  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  44.34 
 
 
327 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  47.84 
 
 
322 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 
340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  46.91 
 
 
325 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  44.11 
 
 
322 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  44.95 
 
 
324 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  45.85 
 
 
318 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  45.85 
 
 
318 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  45.85 
 
 
318 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  45.85 
 
 
318 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  44.52 
 
 
319 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  45.3 
 
 
317 aa  252  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  45.6 
 
 
320 aa  248  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
323 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  46.03 
 
 
316 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.01 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  43.14 
 
 
313 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  45.22 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  42.48 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.6 
 
 
308 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 
350 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  45.27 
 
 
333 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.92 
 
 
308 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  43.19 
 
 
319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  39.27 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  42.33 
 
 
307 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  45.8 
 
 
323 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 
314 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
309 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.79 
 
 
308 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  52.34 
 
 
512 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  37.46 
 
 
301 aa  228  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  51.87 
 
 
510 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  51.63 
 
 
594 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  46.61 
 
 
270 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  50.7 
 
 
585 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  41.3 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  46.64 
 
 
247 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  47.64 
 
 
248 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  51.64 
 
 
1171 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  42.18 
 
 
307 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  50.23 
 
 
582 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  50.23 
 
 
581 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  44.34 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  47.39 
 
 
576 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  48.84 
 
 
590 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  49.3 
 
 
590 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  48.86 
 
 
580 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  40.52 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  49.17 
 
 
593 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
589 aa  212  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  47.2 
 
 
582 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  39.74 
 
 
312 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 
541 aa  211  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  41.1 
 
 
311 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  39.46 
 
 
305 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  51.17 
 
 
257 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  41.64 
 
 
307 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  48.88 
 
 
578 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  39.6 
 
 
315 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  43.86 
 
 
580 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>