More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0808 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 315 aa  635    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  50 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  48.7 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  48.84 
 
 		 305 aa  277  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  48.84 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  45.39 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  50.33 
 
 		 311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  49.67 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  47.35 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  48.69 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  46.84 
 
 		 307 aa  268  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  57.4 
 
 		 512 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  46.3 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  45.07 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  43.95 
 
 		 312 aa  249  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  43.97 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  58.33 
 
 		 510 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  44.34 
 
 		 310 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  46.05 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  45.18 
 
 		 317 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  44.44 
 
 		 667 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  50.21 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  43.46 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  37.91 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  42.39 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 		 578 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.51 
 
 		 578 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 578 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 		 578 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  41.51 
 
 		 578 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  41.51 
 
 		 578 aa  225  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 		 578 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 578 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  50.43 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 578 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  50.43 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.26 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 589 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  50 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  41.86 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  39.16 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  56.37 
 
 		 578 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  47.72 
 
 		 579 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 583 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  42.33 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  39.54 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  39.29 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  36.86 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.38 
 
 		 651 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  42.04 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  37.79 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  36.84 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  37.3 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 578 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 578 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  38.19 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  44.87 
 
 		 575 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 578 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 578 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 578 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  46.86 
 
 		 593 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  49.15 
 
 		 576 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  41.75 
 
 		 592 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  38.94 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  38.19 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 592 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  40.67 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  38.28 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  48.86 
 
 		 593 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  44.44 
 
 		 594 aa  208  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  42.19 
 
 		 599 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  41.64 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  41.14 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  35.5 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  41.27 
 
 		 576 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  41.25 
 
 		 590 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  36.91 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  45.61 
 
 		 580 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  42.86 
 
 		 599 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  41.56 
 
 		 590 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  39.42 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  43.13 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  40.88 
 
 		 588 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  43 
 
 		 1106 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.26 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 585 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  46.26 
 
 		 580 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  48.91 
 
 		 581 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  49.3 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  44.87 
 
 		 587 aa  203  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  46.26 
 
 		 580 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  39.09 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  39.48 
 
 		 328 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>