More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0457 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  100 
 
 		 331 aa  668    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.4 
 
 		 311 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  69.4 
 
 		 311 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  69.4 
 
 		 313 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  68.92 
 
 		 317 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  68.79 
 
 		 314 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  61.23 
 
 		 318 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  60.06 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  58.36 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  58.71 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  58.01 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  56.91 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  58.36 
 
 		 323 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  58.33 
 
 		 322 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  58.36 
 
 		 323 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  58.31 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  57.88 
 
 		 316 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 		 309 aa  355  5e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  58.54 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  57.64 
 
 		 328 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  54.92 
 
 		 315 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  57.01 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  60.19 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  57.19 
 
 		 304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  56.41 
 
 		 305 aa  341  9e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  56.35 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  55.96 
 
 		 354 aa  338  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  58.54 
 
 		 302 aa  335  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  55.45 
 
 		 308 aa  326  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  59.57 
 
 		 691 aa  311  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  43.21 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 323 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  47.57 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  45.69 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  46.82 
 
 		 319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  45.28 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  39.48 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  45.17 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  42.77 
 
 		 319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  47.28 
 
 		 322 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  44.73 
 
 		 346 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  39.16 
 
 		 308 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  42.41 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  45.21 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  42.95 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  47.59 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  47.59 
 
 		 350 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  45.25 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  45.25 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  45.25 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  44.12 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  45.25 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 327 aa  242  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  43.09 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  42.95 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  45.93 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  44.41 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  42.07 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.87 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.24 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  41.4 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  47.84 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  42.54 
 
 		 308 aa  235  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  41.59 
 
 		 323 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  41.93 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  50.67 
 
 		 510 aa  229  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  47.44 
 
 		 270 aa  229  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  52.42 
 
 		 512 aa  228  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  42.55 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  43.53 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  47.73 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  41.29 
 
 		 291 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  39.35 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  45.67 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  47.2 
 
 		 247 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  45.13 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 578 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 578 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  46.3 
 
 		 583 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 578 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 578 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  42.56 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 578 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  47 
 
 		 582 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  45.85 
 
 		 579 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 580 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  46.08 
 
 		 580 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  48.02 
 
 		 257 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  49.1 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 578 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 578 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 578 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 578 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  44.78 
 
 		 576 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  44.98 
 
 		 578 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>