More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2708 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  100 
 
 
691 aa  1372    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  50.26 
 
 
381 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  53.19 
 
 
374 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  48.13 
 
 
379 aa  359  7e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  48.03 
 
 
387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  47.91 
 
 
388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  48.03 
 
 
378 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  46.68 
 
 
380 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  47.91 
 
 
384 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  47.91 
 
 
384 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  48.53 
 
 
384 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  47.11 
 
 
384 aa  346  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  49.6 
 
 
390 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  47.89 
 
 
382 aa  340  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  49.47 
 
 
378 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  47.62 
 
 
378 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  49.07 
 
 
385 aa  336  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  47.49 
 
 
378 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  45.38 
 
 
376 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  47.06 
 
 
390 aa  330  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  46.92 
 
 
378 aa  327  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  54.8 
 
 
318 aa  327  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  59.55 
 
 
322 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  48 
 
 
371 aa  323  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  34.63 
 
 
994 aa  323  6e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  54.61 
 
 
326 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  46.68 
 
 
390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  57.39 
 
 
323 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  58.06 
 
 
313 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  54.26 
 
 
326 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  58.18 
 
 
304 aa  318  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  58.04 
 
 
318 aa  318  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 
321 aa  318  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  57.04 
 
 
323 aa  318  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.82 
 
 
907 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  46.09 
 
 
385 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
311 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  56.93 
 
 
314 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 
312 aa  313  9e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  59.85 
 
 
354 aa  312  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 
309 aa  312  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  32.8 
 
 
913 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  54.38 
 
 
315 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  32.8 
 
 
913 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.21 
 
 
914 aa  311  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  32.8 
 
 
913 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  57.56 
 
 
317 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  56.63 
 
 
311 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  61.73 
 
 
302 aa  309  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  32.66 
 
 
913 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  45.58 
 
 
382 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  31.15 
 
 
914 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 
328 aa  306  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  55.23 
 
 
316 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  33.58 
 
 
930 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  33 
 
 
916 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  31.92 
 
 
933 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  30.88 
 
 
925 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  32.48 
 
 
929 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  30.42 
 
 
920 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  56.46 
 
 
323 aa  304  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  32.36 
 
 
911 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 
305 aa  302  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  32.83 
 
 
1106 aa  302  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  32.22 
 
 
911 aa  303  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  30.77 
 
 
927 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  30.57 
 
 
932 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  57.04 
 
 
331 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  56.38 
 
 
328 aa  302  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  32.36 
 
 
911 aa  301  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  45.62 
 
 
378 aa  301  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  32.35 
 
 
908 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  31.15 
 
 
921 aa  300  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  32.22 
 
 
911 aa  300  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  32.36 
 
 
911 aa  300  7e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  32.36 
 
 
911 aa  300  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  32.36 
 
 
911 aa  300  7e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  32.36 
 
 
911 aa  299  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  32.36 
 
 
911 aa  299  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  44.21 
 
 
377 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  33.73 
 
 
911 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  44.85 
 
 
390 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  32.68 
 
 
912 aa  298  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  59.57 
 
 
331 aa  298  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  43.46 
 
 
368 aa  298  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  31.93 
 
 
901 aa  296  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  31.05 
 
 
904 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  31.14 
 
 
919 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  32.23 
 
 
916 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  31.6 
 
 
917 aa  295  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  31.73 
 
 
1171 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  33.23 
 
 
911 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  30.35 
 
 
922 aa  293  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  31.99 
 
 
916 aa  292  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  59.85 
 
 
316 aa  293  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  44.21 
 
 
377 aa  292  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.39 
 
 
913 aa  291  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  31.67 
 
 
912 aa  289  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  30.26 
 
 
926 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  31.32 
 
 
912 aa  289  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>