More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4664 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  66.99 
 
 		 911 aa  1254    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  66.99 
 
 		 911 aa  1254    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  70.72 
 
 		 930 aa  1307    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  54.69 
 
 		 906 aa  978    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.03 
 
 		 907 aa  1012    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  67.1 
 
 		 911 aa  1254    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  64.05 
 
 		 922 aa  1173    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  73.83 
 
 		 922 aa  1382    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  69.08 
 
 		 1071 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  62.07 
 
 		 920 aa  1137    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  66.99 
 
 		 911 aa  1254    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  73.04 
 
 		 924 aa  1361    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  67.43 
 
 		 913 aa  1252    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  70.87 
 
 		 1082 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  55.53 
 
 		 906 aa  973    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  55.52 
 
 		 901 aa  936    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  61.38 
 
 		 994 aa  1121    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  58.93 
 
 		 904 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  64.66 
 
 		 936 aa  1169    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  66.99 
 
 		 911 aa  1253    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  66.92 
 
 		 911 aa  1250    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  67.1 
 
 		 911 aa  1255    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  66.12 
 
 		 927 aa  1202    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  58.6 
 
 		 943 aa  1062    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  67.65 
 
 		 913 aa  1254    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  59.13 
 
 		 912 aa  1031    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  57.92 
 
 		 932 aa  1042    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.26 
 
 		 1017 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  57.44 
 
 		 912 aa  1025    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  50.26 
 
 		 942 aa  872    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  65.66 
 
 		 921 aa  1212    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  67.65 
 
 		 913 aa  1255    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  81.16 
 
 		 925 aa  1505    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  62.12 
 
 		 942 aa  1061    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  58.31 
 
 		 911 aa  1008    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  58.9 
 
 		 912 aa  1041    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  56.98 
 
 		 901 aa  941    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  64.22 
 
 		 930 aa  1147    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.13 
 
 		 914 aa  950    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  62.34 
 
 		 911 aa  1116    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  79.83 
 
 		 930 aa  1430    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  100 
 
 		 927 aa  1870    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  66.23 
 
 		 921 aa  1184    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  63.69 
 
 		 918 aa  1148    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  55.03 
 
 		 916 aa  976    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  69.91 
 
 		 914 aa  1280    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  64.79 
 
 		 927 aa  1149    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  73.58 
 
 		 926 aa  1374    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  69.94 
 
 		 929 aa  1268    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.94 
 
 		 913 aa  943    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  60.39 
 
 		 908 aa  1083    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  77.99 
 
 		 933 aa  1464    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  57.22 
 
 		 915 aa  1022    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  64.87 
 
 		 919 aa  1159    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  53.36 
 
 		 928 aa  958    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  54.37 
 
 		 906 aa  972    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  57.58 
 
 		 917 aa  1055    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  66.99 
 
 		 911 aa  1254    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  54.29 
 
 		 935 aa  995    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  67.54 
 
 		 913 aa  1255    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  59.8 
 
 		 912 aa  1047    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  67.1 
 
 		 911 aa  1254    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  54.36 
 
 		 918 aa  1001    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  65.92 
 
 		 901 aa  1190    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  65.87 
 
 		 916 aa  1175    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  62.36 
 
 		 936 aa  1082    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  68.36 
 
 		 1089 aa  698    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  69.81 
 
 		 912 aa  1251    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  66.2 
 
 		 916 aa  1201    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  58.91 
 
 		 909 aa  1038    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  64.76 
 
 		 936 aa  1169    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  69.08 
 
 		 1071 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  55.59 
 
 		 901 aa  934    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  70.87 
 
 		 1066 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  54.48 
 
 		 906 aa  975    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  69.08 
 
 		 1079 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  39.2 
 
 		 651 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.37 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  41.27 
 
 		 578 aa  362  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  37.82 
 
 		 580 aa  361  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  39.17 
 
 		 594 aa  361  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  37.65 
 
 		 580 aa  360  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40 
 
 		 510 aa  355  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  39.73 
 
 		 593 aa  352  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  38.64 
 
 		 593 aa  346  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 583 aa  345  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  39.72 
 
 		 599 aa  343  9e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  39.97 
 
 		 585 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  38.49 
 
 		 588 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  36.78 
 
 		 582 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 578 aa  340  9e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.86 
 
 		 578 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 578 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 578 aa  340  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  35.86 
 
 		 578 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 578 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 578 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  35.86 
 
 		 578 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 578 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  37.95 
 
 		 575 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>