More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1432 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  63.25 
 
 
936 aa  1130    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  64.6 
 
 
911 aa  1167    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  64.6 
 
 
911 aa  1167    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  63.36 
 
 
930 aa  1128    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  60.39 
 
 
926 aa  1129    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  54.92 
 
 
906 aa  946    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  55.56 
 
 
907 aa  957    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  54.89 
 
 
917 aa  989    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  68.1 
 
 
1079 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  57.03 
 
 
912 aa  984    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  60.77 
 
 
922 aa  1124    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  68.1 
 
 
1071 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  57.03 
 
 
912 aa  965    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  59.78 
 
 
920 aa  1100    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  64.61 
 
 
913 aa  1175    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  56.72 
 
 
932 aa  1003    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  68.1 
 
 
1082 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  55.87 
 
 
912 aa  975    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  54.74 
 
 
906 aa  930    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  52.64 
 
 
901 aa  884    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  64.6 
 
 
911 aa  1168    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  64.6 
 
 
911 aa  1167    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  52.93 
 
 
901 aa  885    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  62.21 
 
 
933 aa  1144    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  64.49 
 
 
911 aa  1165    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  55.05 
 
 
906 aa  950    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  63.62 
 
 
927 aa  1143    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  62.09 
 
 
921 aa  1138    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  64.61 
 
 
913 aa  1175    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.19 
 
 
914 aa  912    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  64.27 
 
 
911 aa  1160    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  68.58 
 
 
1017 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  53.42 
 
 
928 aa  921    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  64.6 
 
 
911 aa  1168    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  56.26 
 
 
916 aa  976    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  64.6 
 
 
911 aa  1167    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  67.9 
 
 
1089 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  62.51 
 
 
925 aa  1135    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  55.14 
 
 
906 aa  948    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  63.25 
 
 
918 aa  1112    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  56.76 
 
 
943 aa  1014    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  61.52 
 
 
924 aa  1096    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  62.07 
 
 
930 aa  1104    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  49.13 
 
 
942 aa  845    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  64.5 
 
 
913 aa  1173    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  68.74 
 
 
911 aa  1234    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  61.16 
 
 
930 aa  1080    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  60.49 
 
 
927 aa  1096    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  62.16 
 
 
921 aa  1119    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  61.98 
 
 
914 aa  1130    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  63.43 
 
 
927 aa  1101    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  58.12 
 
 
994 aa  1053    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  56.82 
 
 
915 aa  1007    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  100 
 
 
908 aa  1834    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.23 
 
 
913 aa  936    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  64.5 
 
 
913 aa  1172    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  61.68 
 
 
919 aa  1119    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  61.58 
 
 
922 aa  1112    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  66.52 
 
 
916 aa  1192    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  53.25 
 
 
935 aa  981    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  60.68 
 
 
942 aa  1044    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  63.75 
 
 
929 aa  1129    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  64.27 
 
 
911 aa  1164    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  53.96 
 
 
918 aa  993    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  68.59 
 
 
901 aa  1213    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  66.3 
 
 
916 aa  1176    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  56.54 
 
 
904 aa  964    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  57.01 
 
 
912 aa  983    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  61.73 
 
 
936 aa  1057    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  60.15 
 
 
912 aa  1040    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  67.76 
 
 
1066 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  52.81 
 
 
901 aa  883    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  58.68 
 
 
909 aa  1007    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  57.03 
 
 
911 aa  954    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  63.47 
 
 
936 aa  1134    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  68.1 
 
 
1071 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.1 
 
 
512 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  38.99 
 
 
576 aa  359  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  41.05 
 
 
510 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  39.78 
 
 
575 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  41.03 
 
 
578 aa  347  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  38 
 
 
590 aa  340  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
541 aa  340  9e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  38 
 
 
590 aa  340  9e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  37.84 
 
 
585 aa  331  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  36.91 
 
 
580 aa  327  7e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  36.86 
 
 
587 aa  319  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  34.97 
 
 
551 aa  313  7.999999999999999e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  32.81 
 
 
1106 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  37.17 
 
 
593 aa  299  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  32.36 
 
 
691 aa  296  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  35.41 
 
 
667 aa  283  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  49.4 
 
 
582 aa  233  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  46.3 
 
 
594 aa  230  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  34.5 
 
 
384 aa  227  7e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
580 aa  227  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  45.49 
 
 
576 aa  227  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  43.54 
 
 
580 aa  227  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  46.36 
 
 
651 aa  226  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  44.28 
 
 
582 aa  226  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>