More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0699 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0699  ATPase  100 
 
 
354 aa  724    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  60 
 
 
326 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  59.33 
 
 
326 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  62.37 
 
 
304 aa  363  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  55.94 
 
 
323 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  58.2 
 
 
321 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  58.5 
 
 
315 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  61.02 
 
 
328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  56.7 
 
 
322 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  57.67 
 
 
309 aa  353  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  60.2 
 
 
311 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  57.67 
 
 
312 aa  353  4e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  58.61 
 
 
313 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  58.04 
 
 
317 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  56.07 
 
 
318 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  57 
 
 
311 aa  348  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  56.68 
 
 
323 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  56.68 
 
 
323 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  57.01 
 
 
331 aa  342  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  55.19 
 
 
314 aa  338  9e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  54.66 
 
 
316 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  56.71 
 
 
305 aa  329  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  58.14 
 
 
302 aa  328  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  54.9 
 
 
318 aa  326  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  55.96 
 
 
331 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  55.37 
 
 
328 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  59.85 
 
 
691 aa  312  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  55.88 
 
 
316 aa  309  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  53.38 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  52.16 
 
 
317 aa  301  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  44.55 
 
 
314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  45.93 
 
 
324 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  46.38 
 
 
315 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  44.63 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  40.26 
 
 
308 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  39.61 
 
 
308 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  41.99 
 
 
319 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  44.82 
 
 
335 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  46.77 
 
 
325 aa  242  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  42.14 
 
 
333 aa  241  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
309 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  42.42 
 
 
319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  44.63 
 
 
322 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
312 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  44.78 
 
 
291 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  39.69 
 
 
314 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  43.19 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.9 
 
 
316 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  41.08 
 
 
307 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  41.88 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  43.38 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  50.21 
 
 
512 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 
315 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  41.27 
 
 
319 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 
323 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  43.23 
 
 
311 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  47.35 
 
 
510 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  41.72 
 
 
305 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  44.81 
 
 
323 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  42.3 
 
 
317 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  48.4 
 
 
255 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  38.82 
 
 
301 aa  227  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  41.16 
 
 
314 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  41.06 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
327 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  43.61 
 
 
323 aa  225  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 
308 aa  225  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  42.37 
 
 
313 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.67 
 
 
308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  42 
 
 
308 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  41.82 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  44.23 
 
 
340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  42.33 
 
 
315 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  41.23 
 
 
346 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.56 
 
 
322 aa  219  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  47.37 
 
 
248 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  41.23 
 
 
346 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  42.09 
 
 
346 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
307 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  39.93 
 
 
310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  42.38 
 
 
311 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  46.95 
 
 
270 aa  215  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  38.27 
 
 
667 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  39.24 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  46.95 
 
 
247 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  39.12 
 
 
317 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
308 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  40.33 
 
 
318 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  40.33 
 
 
318 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  40.33 
 
 
318 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  47.3 
 
 
581 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  47.27 
 
 
585 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  37.34 
 
 
312 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  40.8 
 
 
318 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  50.93 
 
 
578 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  40.2 
 
 
307 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 
257 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  46.36 
 
 
582 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  45.91 
 
 
576 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>