More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0408 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  100 
 
 
331 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  84.92 
 
 
328 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  77.39 
 
 
326 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  79.34 
 
 
326 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  76.92 
 
 
321 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  73.53 
 
 
318 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  74.92 
 
 
322 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  73.29 
 
 
323 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  73.29 
 
 
323 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  69.28 
 
 
315 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  63.93 
 
 
304 aa  408  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  63.61 
 
 
313 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
311 aa  394  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  62.9 
 
 
317 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  62.3 
 
 
316 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  61.34 
 
 
314 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 
312 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  60.12 
 
 
318 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  59.73 
 
 
309 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  62.21 
 
 
311 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  61.39 
 
 
305 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  59.47 
 
 
323 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  60.82 
 
 
328 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  57.01 
 
 
354 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  60.91 
 
 
302 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  63.21 
 
 
316 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  57.01 
 
 
331 aa  350  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  56.49 
 
 
308 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  53.62 
 
 
317 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  57.04 
 
 
691 aa  328  7e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  41.53 
 
 
308 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  46.06 
 
 
315 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  43.45 
 
 
324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  44.88 
 
 
314 aa  272  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  39.87 
 
 
308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 
320 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  49.43 
 
 
340 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  47.35 
 
 
318 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  47.35 
 
 
318 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  47.67 
 
 
346 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  47.67 
 
 
346 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  47.35 
 
 
318 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  43.64 
 
 
319 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  47.35 
 
 
318 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  44.04 
 
 
335 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  47.83 
 
 
346 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  47.16 
 
 
325 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  43.3 
 
 
319 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  45.63 
 
 
319 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  46.33 
 
 
317 aa  259  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  43.23 
 
 
322 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.3 
 
 
322 aa  257  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  44.48 
 
 
322 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  44.07 
 
 
313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
308 aa  252  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  43.44 
 
 
333 aa  252  8.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 
309 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  43.45 
 
 
327 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.27 
 
 
316 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  43.04 
 
 
314 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
350 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  44.12 
 
 
312 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40 
 
 
308 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  48.89 
 
 
255 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.4 
 
 
308 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
323 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  41.2 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  51.83 
 
 
512 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 
308 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  49.77 
 
 
270 aa  238  9e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  50 
 
 
510 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  39.74 
 
 
301 aa  235  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  46.06 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  47.66 
 
 
247 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  41.45 
 
 
312 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  44.44 
 
 
248 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  40.92 
 
 
311 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  40.13 
 
 
311 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  41.14 
 
 
291 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  47.98 
 
 
582 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  44.63 
 
 
581 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  40.33 
 
 
308 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  48.5 
 
 
1171 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  44 
 
 
578 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.8 
 
 
578 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  44.8 
 
 
578 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  45.73 
 
 
576 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
578 aa  219  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
578 aa  219  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
578 aa  219  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
578 aa  219  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  44.8 
 
 
578 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
578 aa  219  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
578 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  48 
 
 
579 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  45.92 
 
 
585 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  44.44 
 
 
594 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  44.39 
 
 
667 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  43.09 
 
 
575 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>