More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0164 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 321 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  86.21 
 
 		 326 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  85.89 
 
 		 326 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  79.67 
 
 		 328 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  72.9 
 
 		 318 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  76.75 
 
 		 322 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  73.94 
 
 		 323 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  73.64 
 
 		 323 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  71.9 
 
 		 315 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  76.92 
 
 		 331 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  66.67 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.25 
 
 		 311 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  63.04 
 
 		 316 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  62.91 
 
 		 313 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  59.68 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  62.25 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  58.86 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  61.46 
 
 		 305 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  58.86 
 
 		 312 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  60.71 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  61.31 
 
 		 311 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  58.94 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  63.46 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  62.5 
 
 		 302 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  58.2 
 
 		 354 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  58.55 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  57.67 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  58.36 
 
 		 331 aa  348  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  54.3 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  55.44 
 
 		 691 aa  315  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  45.96 
 
 		 319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  46.42 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  44.59 
 
 		 314 aa  275  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  47.51 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  43.93 
 
 		 324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  41.28 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  42.77 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  39.93 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  45.78 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  45.78 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  42.77 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  44.63 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  46.64 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  42.33 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  42.21 
 
 		 335 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  44.22 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  45.85 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  44.52 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  44.52 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  44.52 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  43.28 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  44.52 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  41.88 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  43.97 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  43.43 
 
 		 313 aa  245  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  44.37 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.4 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.67 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  43.41 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  45.17 
 
 		 340 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.99 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  39.53 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  48.66 
 
 		 510 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  50.46 
 
 		 323 aa  235  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  47.84 
 
 		 512 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  46.79 
 
 		 255 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  41.58 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  46.51 
 
 		 270 aa  228  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  44.8 
 
 		 248 aa  225  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.63 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  40.72 
 
 		 315 aa  222  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  41.56 
 
 		 312 aa  221  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  40.4 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  42.24 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  37.11 
 
 		 667 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  44.04 
 
 		 247 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  41.14 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  40.86 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  41 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  40.37 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  39.68 
 
 		 308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  45.93 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  38.28 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  40.58 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  38.28 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.81 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  43.81 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  43.81 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  39.53 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>