More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4202 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  100 
 
 		 335 aa  684    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  69.33 
 
 		 323 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  64.63 
 
 		 346 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  66.45 
 
 		 346 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  68.23 
 
 		 346 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  66 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  66.89 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  66.89 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  66.89 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  66.89 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  66.22 
 
 		 322 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  64.5 
 
 		 327 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  64.03 
 
 		 308 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  62.14 
 
 		 322 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  62.05 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  62.71 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  63.55 
 
 		 313 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  60 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  57.63 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  54.46 
 
 		 315 aa  345  4e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  47.16 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  46.23 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  46.25 
 
 		 325 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  46.03 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  45.45 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  44.66 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.37 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  43.43 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  44.12 
 
 		 314 aa  261  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  43.28 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  44.37 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  44.52 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  43.38 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  43.08 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  45.36 
 
 		 316 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  42.02 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  44.37 
 
 		 317 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  46.33 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  45.09 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 		 321 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  41.37 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.16 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  43.62 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  41.86 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.42 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  41.75 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  43.21 
 
 		 331 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  43.09 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  46.33 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  41.06 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  44.82 
 
 		 354 aa  245  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  42.76 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  42.76 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  40.94 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  40.32 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 305 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  44.79 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  45.92 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  42.03 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  41.72 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  40 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  44.04 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  43.19 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  40.91 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  41.95 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  43.88 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  41 
 
 		 315 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  39.46 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  51.39 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  46.05 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  39.81 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  40.6 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  40.67 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  45.71 
 
 		 917 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  40.27 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  40.06 
 
 		 667 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  50.91 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  44.81 
 
 		 691 aa  229  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  42.8 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  43.77 
 
 		 593 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  41.45 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  47.77 
 
 		 585 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  46.93 
 
 		 581 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.94 
 
 		 651 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  44.93 
 
 		 512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  41.12 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  45.26 
 
 		 582 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  43.44 
 
 		 901 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  38.28 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  40 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  41.04 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>