More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0657 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  100 
 
 
320 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  78.06 
 
 
324 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  68.59 
 
 
333 aa  431  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  68.32 
 
 
319 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  67.66 
 
 
319 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  64.57 
 
 
308 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  57.52 
 
 
314 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  74.89 
 
 
512 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  74.89 
 
 
510 aa  349  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  52.81 
 
 
309 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  52.94 
 
 
322 aa  328  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  53 
 
 
319 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  52.49 
 
 
316 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  49.84 
 
 
307 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  51.31 
 
 
350 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  51.49 
 
 
325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  47.5 
 
 
314 aa  308  5.9999999999999995e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  50.32 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  46.95 
 
 
315 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  57.26 
 
 
247 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  55.17 
 
 
248 aa  285  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  46.38 
 
 
312 aa  281  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  48.87 
 
 
322 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  48.55 
 
 
322 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  54.78 
 
 
270 aa  275  6e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  48.38 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  56.77 
 
 
581 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  54.26 
 
 
255 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  56.52 
 
 
257 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  44.59 
 
 
318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  44.34 
 
 
667 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  54.81 
 
 
585 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  46.86 
 
 
308 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  46.18 
 
 
314 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  57.21 
 
 
594 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  42.86 
 
 
315 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  44.7 
 
 
307 aa  268  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  56.5 
 
 
582 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  45.06 
 
 
323 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  45.03 
 
 
307 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  46.1 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  45.4 
 
 
323 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  52.63 
 
 
575 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  43.89 
 
 
307 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 
322 aa  265  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 
309 aa  264  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 
321 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  43.99 
 
 
312 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  46.05 
 
 
304 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  43.42 
 
 
305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  53.68 
 
 
255 aa  259  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  44.23 
 
 
311 aa  258  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  54.5 
 
 
590 aa  258  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  54.95 
 
 
590 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  55.16 
 
 
576 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  44.88 
 
 
323 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  43.35 
 
 
328 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  44.52 
 
 
316 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  41.91 
 
 
311 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  44.82 
 
 
651 aa  256  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  53.85 
 
 
580 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.86 
 
 
314 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  43.19 
 
 
326 aa  255  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  50.99 
 
 
1171 aa  255  7e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  42.53 
 
 
308 aa  255  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  44.63 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  53.46 
 
 
582 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  51.69 
 
 
578 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  52.36 
 
 
579 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  51.69 
 
 
578 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  51.69 
 
 
578 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  54.38 
 
 
580 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  54.38 
 
 
580 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 
578 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 
578 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 
578 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  45.63 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 
578 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  51.69 
 
 
578 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 
578 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  52.12 
 
 
275 aa  253  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  42.62 
 
 
323 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  45.72 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  43.32 
 
 
308 aa  252  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  42.3 
 
 
315 aa  252  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.01 
 
 
308 aa  252  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  42.02 
 
 
326 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  44.59 
 
 
313 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 
578 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  50 
 
 
578 aa  250  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 
580 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  50.64 
 
 
580 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 
578 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 
578 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 
578 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  43.33 
 
 
291 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  53.02 
 
 
583 aa  248  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  45.6 
 
 
318 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  51.8 
 
 
578 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  54.59 
 
 
1106 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>