More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0859 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  100 
 
 		 319 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  60.19 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  61.24 
 
 		 350 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  58.82 
 
 		 316 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  53.95 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  52.6 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  52.98 
 
 		 320 aa  325  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  51.46 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  51.18 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 		 308 aa  315  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  51.32 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 312 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  48.23 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  48.22 
 
 		 319 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  46.84 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  56.71 
 
 		 510 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  55.7 
 
 		 512 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  51.16 
 
 		 314 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  49.83 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  49.49 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  48.84 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  50.17 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  47.73 
 
 		 315 aa  266  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  46.71 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  46.71 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  43.43 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  47.12 
 
 		 328 aa  262  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  49.78 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  53.51 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  50.91 
 
 		 270 aa  258  8e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  47.73 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  47.02 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  43.91 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 		 322 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  45.57 
 
 		 314 aa  255  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  43.85 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  44.44 
 
 		 667 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  44.41 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  44.33 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  46.36 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  45.78 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  53.51 
 
 		 255 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  44.87 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  50.91 
 
 		 247 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  43.81 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  44.73 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  52.63 
 
 		 575 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  42.71 
 
 		 311 aa  249  6e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  50 
 
 		 589 aa  248  9e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  42.99 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  46.08 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  52.23 
 
 		 582 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.86 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.86 
 
 		 308 aa  245  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  51.07 
 
 		 576 aa  244  9e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  42.43 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  54.3 
 
 		 593 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  46.69 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  52.51 
 
 		 257 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  41.58 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  43.55 
 
 		 316 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  51.91 
 
 		 581 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  51.09 
 
 		 594 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  53.3 
 
 		 578 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  42.16 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  39.81 
 
 		 651 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 583 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 		 579 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 541 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  50.22 
 
 		 582 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  49.57 
 
 		 599 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  50.45 
 
 		 580 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  43.93 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  50.23 
 
 		 579 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  49.12 
 
 		 580 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 		 580 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  50.23 
 
 		 580 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 578 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 578 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  54.3 
 
 		 585 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  43.56 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.05 
 
 		 578 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  48.05 
 
 		 578 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 578 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  48.05 
 
 		 578 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 578 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  48.05 
 
 		 578 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  48.05 
 
 		 578 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  40.07 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  55.61 
 
 		 578 aa  235  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>