More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0115 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  100 
 
 		 301 aa  624  1e-178  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  64 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  62.3 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  59 
 
 		 312 aa  364  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  53.82 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  48.69 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.38 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  43.19 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  42.81 
 
 		 311 aa  258  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 315 aa  255  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  43.52 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  41.86 
 
 		 315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  41.25 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  41 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  40.19 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  39.55 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  42.02 
 
 		 323 aa  241  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  42.47 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  40.72 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  39.27 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  39.09 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  49.56 
 
 		 512 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  37.67 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  39 
 
 		 315 aa  235  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  40.33 
 
 		 305 aa  234  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  38.28 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  40.51 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.73 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  40.27 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  38.28 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  40.47 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  39.4 
 
 		 317 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  38.61 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  38.87 
 
 		 590 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  39.94 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  40.59 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  40.53 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  37.46 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  39.53 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  40.53 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  38.82 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  38.61 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  39.33 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  38.16 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  38.54 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.21 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  39.06 
 
 		 590 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  49.1 
 
 		 510 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  40.19 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  45.25 
 
 		 594 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  40.19 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  38.1 
 
 		 335 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  37.33 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  38.82 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  45.42 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  38.13 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  41.44 
 
 		 580 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 		 580 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  39.67 
 
 		 579 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  37.74 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  43.78 
 
 		 575 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  36.36 
 
 		 333 aa  212  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  43.61 
 
 		 270 aa  211  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  39.03 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.21 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  37.29 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  37.79 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  39.74 
 
 		 331 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  35.57 
 
 		 322 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  45.45 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 583 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  42.49 
 
 		 580 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  43.3 
 
 		 581 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  38.08 
 
 		 316 aa  205  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.68 
 
 		 667 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  37.41 
 
 		 578 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  36.7 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 578 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 1171 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 578 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 578 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 578 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  42.34 
 
 		 578 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  42.86 
 
 		 585 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 578 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>