More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2901 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  74.56 
 
 		 578 aa  884    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  74.56 
 
 		 578 aa  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  57.86 
 
 		 585 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  58.02 
 
 		 590 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 580 aa  1186    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  74.56 
 
 		 578 aa  884    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  74.56 
 
 		 578 aa  884    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  58.82 
 
 		 580 aa  677    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  58.97 
 
 		 594 aa  687    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  58.82 
 
 		 580 aa  678    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  73.26 
 
 		 578 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  80.07 
 
 		 585 aa  941    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  59.04 
 
 		 578 aa  680    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  74.22 
 
 		 578 aa  879    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  74.39 
 
 		 579 aa  876    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  73.26 
 
 		 578 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  79.2 
 
 		 582 aa  945    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  77.19 
 
 		 583 aa  918    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  56.72 
 
 		 575 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  58.17 
 
 		 590 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  80.6 
 
 		 580 aa  943    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  58.16 
 
 		 582 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  74.56 
 
 		 578 aa  882    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  74.56 
 
 		 578 aa  884    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  73.26 
 
 		 578 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  73.26 
 
 		 578 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  73.26 
 
 		 578 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  58.56 
 
 		 581 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  58.77 
 
 		 576 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  74.56 
 
 		 578 aa  884    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  74.56 
 
 		 578 aa  884    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  100 
 
 		 580 aa  1186    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  84.32 
 
 		 576 aa  999    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  56.14 
 
 		 580 aa  633  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  50.78 
 
 		 579 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  52.55 
 
 		 578 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  49.41 
 
 		 617 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  50.71 
 
 		 599 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  48.5 
 
 		 593 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  46.31 
 
 		 588 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  46.29 
 
 		 587 aa  519  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  49.12 
 
 		 599 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  48 
 
 		 593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 592 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  48.07 
 
 		 592 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  49.82 
 
 		 551 aa  513  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 583 aa  495  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 589 aa  488  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  46.08 
 
 		 1106 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  43.5 
 
 		 510 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  39.67 
 
 		 651 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.93 
 
 		 914 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  38.9 
 
 		 667 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  39.35 
 
 		 916 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  39.35 
 
 		 916 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  37.54 
 
 		 915 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  37.72 
 
 		 924 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  37.11 
 
 		 912 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.72 
 
 		 907 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  38.96 
 
 		 916 aa  355  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  36.97 
 
 		 913 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  38.13 
 
 		 912 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  37.5 
 
 		 913 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  37.5 
 
 		 913 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  37.82 
 
 		 912 aa  351  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  38.11 
 
 		 901 aa  349  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  36.96 
 
 		 926 aa  349  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  35.5 
 
 		 922 aa  349  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  36.59 
 
 		 912 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  37.48 
 
 		 901 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  38.48 
 
 		 901 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  37.39 
 
 		 906 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.51 
 
 		 913 aa  340  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 		 930 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  36.7 
 
 		 906 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  37.34 
 
 		 906 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.81 
 
 		 906 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  35.93 
 
 		 914 aa  335  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  36.66 
 
 		 929 aa  332  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  36.04 
 
 		 936 aa  332  8e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  36.22 
 
 		 936 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 1171 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  50.21 
 
 		 512 aa  266  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  51.95 
 
 		 308 aa  259  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  52.68 
 
 		 314 aa  255  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  51.82 
 
 		 324 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  53.18 
 
 		 312 aa  250  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  50.64 
 
 		 320 aa  250  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  45.99 
 
 		 904 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  50.88 
 
 		 319 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  47.43 
 
 		 994 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  52.44 
 
 		 316 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 257 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  52.8 
 
 		 325 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  51.67 
 
 		 333 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  47.3 
 
 		 248 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  48.76 
 
 		 314 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 319 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  46.91 
 
 		 270 aa  243  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>