More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2180 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  70.52 
 
 		 918 aa  1294    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  69.64 
 
 		 911 aa  1291    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  69.64 
 
 		 911 aa  1291    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  100 
 
 		 927 aa  1884    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  69.53 
 
 		 911 aa  1290    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  75.73 
 
 		 1089 aa  757    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  69.34 
 
 		 930 aa  1273    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.58 
 
 		 906 aa  939    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.33 
 
 		 907 aa  973    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  57.95 
 
 		 904 aa  1000    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  65.86 
 
 		 911 aa  1177    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  65.35 
 
 		 922 aa  1214    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  69.14 
 
 		 914 aa  1266    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  66.02 
 
 		 933 aa  1220    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  64.55 
 
 		 926 aa  1204    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  75.73 
 
 		 1071 aa  758    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.23 
 
 		 913 aa  954    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  62.2 
 
 		 920 aa  1131    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  76.28 
 
 		 1082 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  54.42 
 
 		 906 aa  953    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  54.58 
 
 		 901 aa  924    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  69.64 
 
 		 911 aa  1291    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  59.87 
 
 		 994 aa  1125    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  54.96 
 
 		 901 aa  934    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  68.54 
 
 		 901 aa  1239    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  69.64 
 
 		 911 aa  1291    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  68.31 
 
 		 929 aa  1245    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.51 
 
 		 914 aa  937    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  57.49 
 
 		 912 aa  1000    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  57.39 
 
 		 915 aa  1047    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  71.46 
 
 		 922 aa  1303    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  65.55 
 
 		 921 aa  1217    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  57.27 
 
 		 912 aa  970    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  70.55 
 
 		 913 aa  1294    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  52.73 
 
 		 906 aa  937    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  76.09 
 
 		 1017 aa  774    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  69.71 
 
 		 911 aa  1288    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.77 
 
 		 913 aa  1298    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  65.51 
 
 		 925 aa  1203    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  52.58 
 
 		 906 aa  937    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  66.15 
 
 		 924 aa  1207    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  68.89 
 
 		 942 aa  1219    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  70.27 
 
 		 930 aa  1295    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  57.8 
 
 		 932 aa  1032    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  70.44 
 
 		 936 aa  1309    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  65 
 
 		 930 aa  1162    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  66 
 
 		 927 aa  1193    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  74.51 
 
 		 921 aa  1352    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  69.53 
 
 		 911 aa  1289    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  69.95 
 
 		 927 aa  1265    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  68.02 
 
 		 916 aa  1221    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  53.44 
 
 		 928 aa  952    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  55.49 
 
 		 916 aa  992    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  63.62 
 
 		 908 aa  1122    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  70.65 
 
 		 919 aa  1325    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  56.97 
 
 		 912 aa  982    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  54.53 
 
 		 901 aa  923    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  55.59 
 
 		 935 aa  1021    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.77 
 
 		 913 aa  1297    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  69.67 
 
 		 936 aa  1229    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  54.69 
 
 		 918 aa  1012    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  58.7 
 
 		 943 aa  1080    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  69.53 
 
 		 911 aa  1290    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  56.8 
 
 		 917 aa  1022    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  68.06 
 
 		 916 aa  1195    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  56.23 
 
 		 911 aa  972    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  57.52 
 
 		 912 aa  987    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  75.73 
 
 		 1079 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  49.68 
 
 		 942 aa  854    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  64.47 
 
 		 912 aa  1129    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  75.88 
 
 		 1066 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  69.42 
 
 		 911 aa  1289    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  60.29 
 
 		 909 aa  1057    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.77 
 
 		 913 aa  1298    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  70.66 
 
 		 936 aa  1315    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  75.73 
 
 		 1071 aa  758    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  38.15 
 
 		 651 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.05 
 
 		 512 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.7 
 
 		 510 aa  365  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  39.3 
 
 		 593 aa  342  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 		 541 aa  341  5e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  39.38 
 
 		 582 aa  335  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  37.29 
 
 		 581 aa  314  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  31.02 
 
 		 1106 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  34.81 
 
 		 588 aa  312  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  35.08 
 
 		 579 aa  306  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  35.68 
 
 		 590 aa  297  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 		 551 aa  276  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  28.7 
 
 		 691 aa  258  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  43.54 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  46.13 
 
 		 599 aa  227  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  35.24 
 
 		 384 aa  226  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  43.88 
 
 		 248 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 578 aa  221  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.28 
 
 		 578 aa  221  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  42.28 
 
 		 578 aa  221  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 578 aa  221  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 578 aa  221  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 578 aa  221  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 578 aa  221  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>