More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0018 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  60.18 
 
 
911 aa  1079    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  60.18 
 
 
911 aa  1079    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  60.18 
 
 
911 aa  1079    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  60.85 
 
 
930 aa  1081    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.12 
 
 
906 aa  994    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  55.03 
 
 
907 aa  951    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  58.48 
 
 
912 aa  1012    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  60.07 
 
 
911 aa  1075    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  57.52 
 
 
922 aa  1040    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  63.91 
 
 
920 aa  1154    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  60.07 
 
 
911 aa  1077    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  56.41 
 
 
906 aa  1010    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  54.45 
 
 
901 aa  918    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  55.79 
 
 
906 aa  993    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  59.89 
 
 
913 aa  1070    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  62.33 
 
 
901 aa  1076    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  59.89 
 
 
913 aa  1069    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  60 
 
 
913 aa  1070    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  57.36 
 
 
936 aa  963    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  56.86 
 
 
942 aa  956    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  58.65 
 
 
936 aa  1035    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.46 
 
 
914 aa  949    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  59.8 
 
 
911 aa  1076    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  61.66 
 
 
916 aa  1082    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.09 
 
 
913 aa  966    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  60.18 
 
 
911 aa  1078    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  50.16 
 
 
942 aa  880    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  58.95 
 
 
925 aa  1046    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  56.15 
 
 
906 aa  991    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  58.78 
 
 
911 aa  1008    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  60.07 
 
 
911 aa  1075    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  57.39 
 
 
915 aa  1034    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  58.42 
 
 
911 aa  999    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  56.57 
 
 
930 aa  990    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  53.02 
 
 
928 aa  941    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  60.96 
 
 
929 aa  1085    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  59.91 
 
 
930 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  59.16 
 
 
927 aa  1032    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  59.3 
 
 
921 aa  1051    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  60.29 
 
 
927 aa  1064    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  58.08 
 
 
932 aa  1030    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  57.19 
 
 
922 aa  1006    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  58.06 
 
 
927 aa  1003    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  60.02 
 
 
911 aa  1078    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  60.41 
 
 
933 aa  1087    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  58.68 
 
 
908 aa  989    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  60 
 
 
913 aa  1069    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  57.31 
 
 
919 aa  1025    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  58.93 
 
 
914 aa  1065    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  55.1 
 
 
901 aa  916    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  59.36 
 
 
918 aa  1030    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  55.06 
 
 
935 aa  998    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  58.37 
 
 
912 aa  1012    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  56.91 
 
 
917 aa  1028    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  56.74 
 
 
918 aa  1030    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  59.36 
 
 
921 aa  1057    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  56.4 
 
 
994 aa  1036    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  61.14 
 
 
916 aa  1063    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  57.99 
 
 
904 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  57.13 
 
 
943 aa  1029    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  58.08 
 
 
916 aa  1009    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  59.36 
 
 
912 aa  1001    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  58.81 
 
 
912 aa  1002    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  56.58 
 
 
912 aa  1006    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  100 
 
 
909 aa  1832    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  58.54 
 
 
936 aa  1033    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  54.28 
 
 
901 aa  912    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  59.39 
 
 
924 aa  1041    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  58.49 
 
 
926 aa  1071    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  64.2 
 
 
1017 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  64.68 
 
 
1066 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  65.68 
 
 
1071 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  65.68 
 
 
1082 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  65.68 
 
 
1089 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  65.68 
 
 
1079 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  65.68 
 
 
1071 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.62 
 
 
651 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  42.14 
 
 
510 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  40.96 
 
 
512 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  40.07 
 
 
593 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  38.43 
 
 
575 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  40.59 
 
 
579 aa  365  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
583 aa  365  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  38.17 
 
 
576 aa  364  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  42.1 
 
 
578 aa  362  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  38.37 
 
 
590 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  40.46 
 
 
585 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  38.41 
 
 
590 aa  357  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  40.83 
 
 
576 aa  354  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  38.66 
 
 
578 aa  352  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  36.89 
 
 
580 aa  347  4e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  36.71 
 
 
580 aa  346  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 
541 aa  342  2e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  38.13 
 
 
587 aa  327  4.0000000000000003e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  31.08 
 
 
1106 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  31.56 
 
 
691 aa  269  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  53.04 
 
 
582 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  44.91 
 
 
599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  42.57 
 
 
583 aa  231  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  46.48 
 
 
581 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>