More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5442 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  54.39 
 
 
943 aa  952    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  55.79 
 
 
911 aa  978    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  55.79 
 
 
911 aa  978    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  57.16 
 
 
901 aa  977    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  55.79 
 
 
911 aa  976    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  57.16 
 
 
930 aa  999    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  54.19 
 
 
922 aa  930    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  80.15 
 
 
906 aa  1449    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.5 
 
 
907 aa  967    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  53.3 
 
 
928 aa  938    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  54.08 
 
 
922 aa  958    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.85 
 
 
913 aa  941    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  58.15 
 
 
920 aa  1038    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.42 
 
 
914 aa  908    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  55.09 
 
 
911 aa  928    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  100 
 
 
906 aa  1837    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  52.86 
 
 
901 aa  891    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  55.79 
 
 
911 aa  978    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  55.84 
 
 
904 aa  956    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  54.22 
 
 
912 aa  943    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  56.29 
 
 
929 aa  958    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  52.65 
 
 
936 aa  915    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  55.57 
 
 
911 aa  970    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  56.08 
 
 
913 aa  986    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  54.17 
 
 
918 aa  920    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  49.95 
 
 
942 aa  876    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  56.19 
 
 
913 aa  987    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  53.2 
 
 
932 aa  953    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  53.88 
 
 
912 aa  922    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  56.03 
 
 
925 aa  970    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  54.63 
 
 
927 aa  952    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  55.79 
 
 
911 aa  976    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  53.95 
 
 
994 aa  941    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  52.71 
 
 
930 aa  896    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  80.26 
 
 
906 aa  1456    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  55.79 
 
 
916 aa  964    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  55.31 
 
 
917 aa  996    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  55.24 
 
 
930 aa  942    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  56.22 
 
 
927 aa  970    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  53.46 
 
 
921 aa  938    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  52.96 
 
 
926 aa  945    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  55.9 
 
 
911 aa  979    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  80.26 
 
 
906 aa  1454    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  52.4 
 
 
927 aa  865    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  55.79 
 
 
911 aa  978    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  56.92 
 
 
911 aa  968    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  55.01 
 
 
908 aa  910    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  54.87 
 
 
915 aa  955    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  53.1 
 
 
901 aa  901    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  52.37 
 
 
919 aa  917    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  55.03 
 
 
914 aa  962    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  51.82 
 
 
936 aa  851    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  51.74 
 
 
935 aa  921    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  53.02 
 
 
912 aa  930    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  50.49 
 
 
942 aa  849    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  50.55 
 
 
918 aa  918    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  56.08 
 
 
913 aa  987    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  52.2 
 
 
921 aa  910    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  56.67 
 
 
916 aa  945    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  55.57 
 
 
911 aa  976    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  53.77 
 
 
912 aa  938    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  56.08 
 
 
913 aa  985    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  57.08 
 
 
916 aa  971    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  53.84 
 
 
912 aa  899    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  54.76 
 
 
933 aa  969    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  56.63 
 
 
909 aa  992    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  52.61 
 
 
936 aa  914    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  52.54 
 
 
901 aa  887    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  55.79 
 
 
924 aa  984    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  58.5 
 
 
1017 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  58.38 
 
 
1071 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  58.72 
 
 
1066 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  58.38 
 
 
1079 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  59.33 
 
 
1082 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  58.38 
 
 
1089 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  58.38 
 
 
1071 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.94 
 
 
510 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  38.88 
 
 
512 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  37.54 
 
 
589 aa  360  7e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  37.41 
 
 
599 aa  357  7.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  39.2 
 
 
582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  36.7 
 
 
580 aa  337  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 
580 aa  337  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  35.94 
 
 
579 aa  326  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 
541 aa  319  2e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  37.85 
 
 
580 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  38.7 
 
 
576 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  30.76 
 
 
1106 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  31.35 
 
 
1171 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  29.6 
 
 
691 aa  258  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  36.27 
 
 
384 aa  247  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  50.64 
 
 
322 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  48.35 
 
 
575 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  42.61 
 
 
590 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  42.61 
 
 
590 aa  229  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  43.64 
 
 
594 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  46.64 
 
 
315 aa  229  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  46.59 
 
 
578 aa  228  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  44.87 
 
 
599 aa  227  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  43.03 
 
 
247 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>