More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1039 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  70.74 
 
 		 911 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  70.74 
 
 		 911 aa  749    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  97.07 
 
 		 1079 aa  1999    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  73.96 
 
 		 930 aa  760    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  64.31 
 
 		 907 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  66.47 
 
 		 926 aa  712    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  68.24 
 
 		 922 aa  726    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  64.76 
 
 		 928 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  65.55 
 
 		 915 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  96.68 
 
 		 1071 aa  1986    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  63.09 
 
 		 920 aa  688    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  100 
 
 		 1082 aa  2163    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  65.64 
 
 		 901 aa  651    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  70.93 
 
 		 911 aa  750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  72.34 
 
 		 914 aa  765    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  70.74 
 
 		 911 aa  749    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  80.79 
 
 		 942 aa  791    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  70.93 
 
 		 911 aa  750    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  66.34 
 
 		 912 aa  688    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.38 
 
 		 913 aa  638    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  63.33 
 
 		 932 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  70.71 
 
 		 913 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  75.88 
 
 		 927 aa  795    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  73.52 
 
 		 929 aa  765    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  86.57 
 
 		 1017 aa  986    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  72.48 
 
 		 921 aa  745    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.71 
 
 		 913 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  72.22 
 
 		 925 aa  744    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  70.54 
 
 		 911 aa  747    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  68.97 
 
 		 933 aa  753    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  75.98 
 
 		 930 aa  798    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  70.54 
 
 		 911 aa  747    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  72.33 
 
 		 911 aa  747    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  71.54 
 
 		 930 aa  740    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  70.87 
 
 		 927 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  78.9 
 
 		 921 aa  827    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  74.9 
 
 		 922 aa  805    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  71.09 
 
 		 924 aa  743    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  76.67 
 
 		 927 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  73.76 
 
 		 916 aa  752    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  67.76 
 
 		 908 aa  704    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  74.07 
 
 		 901 aa  770    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  66.6 
 
 		 943 aa  682    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  77.41 
 
 		 919 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  68.57 
 
 		 904 aa  697    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  65.72 
 
 		 912 aa  673    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  64.26 
 
 		 935 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  69.7 
 
 		 994 aa  717    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  70.93 
 
 		 911 aa  750    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  65.61 
 
 		 917 aa  685    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  65.19 
 
 		 918 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.91 
 
 		 913 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  80.23 
 
 		 936 aa  802    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  97.97 
 
 		 1066 aa  1993    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  65.72 
 
 		 912 aa  693    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  74.04 
 
 		 916 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  97.8 
 
 		 1089 aa  1977    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  77.3 
 
 		 936 aa  812    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  66.27 
 
 		 911 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  71.18 
 
 		 912 aa  737    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.52 
 
 		 913 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  66.34 
 
 		 912 aa  692    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  66.21 
 
 		 901 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  64.93 
 
 		 909 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  70.93 
 
 		 911 aa  751    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  76.1 
 
 		 936 aa  814    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  96.68 
 
 		 1071 aa  1986    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  65.45 
 
 		 901 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  78.77 
 
 		 918 aa  811    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  60.45 
 
 		 916 aa  625  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  58.98 
 
 		 906 aa  602  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  61.08 
 
 		 942 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  58.43 
 
 		 906 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  58.04 
 
 		 906 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  58.04 
 
 		 906 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.8 
 
 		 914 aa  595  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.62 
 
 		 651 aa  400  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  40.86 
 
 		 512 aa  361  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.15 
 
 		 510 aa  354  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  38.93 
 
 		 599 aa  347  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  37.48 
 
 		 576 aa  345  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 541 aa  336  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  39.45 
 
 		 575 aa  337  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 		 578 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  36.83 
 
 		 578 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 		 578 aa  322  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 		 578 aa  321  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 		 578 aa  322  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  36.11 
 
 		 579 aa  319  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  36.53 
 
 		 588 aa  316  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  36.45 
 
 		 587 aa  291  4e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 551 aa  282  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  48.46 
 
 		 583 aa  240  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  49.24 
 
 		 594 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  44.79 
 
 		 582 aa  234  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  45.49 
 
 		 247 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  47.6 
 
 		 590 aa  231  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 585 aa  230  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  47.04 
 
 		 590 aa  229  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  46.25 
 
 		 580 aa  228  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>