More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1796 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 374 aa  728    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  61.52 
 
 		 371 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  61.52 
 
 		 371 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  57.18 
 
 		 385 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  53.25 
 
 		 1106 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 1171 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  47.68 
 
 		 378 aa  332  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  47.68 
 
 		 376 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  47.43 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  46.67 
 
 		 375 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  44.53 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  45.11 
 
 		 379 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  46.47 
 
 		 375 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  46.79 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  45.01 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  45.41 
 
 		 376 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  45.41 
 
 		 376 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  45.41 
 
 		 376 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  45.41 
 
 		 376 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  45.8 
 
 		 391 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  45.41 
 
 		 376 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  45.68 
 
 		 377 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  45.41 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  45.41 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  45.41 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  45.41 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  45.41 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  45.41 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  45.41 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  45.14 
 
 		 377 aa  319  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  45.36 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  46.4 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  47.7 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  46.13 
 
 		 391 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  47.99 
 
 		 389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  47.45 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  45.45 
 
 		 379 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  46.65 
 
 		 389 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  44.74 
 
 		 387 aa  299  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  41.24 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  45.23 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  41.24 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  40.7 
 
 		 373 aa  289  6e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  42.18 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  45.43 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  44.32 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  39.89 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  39.19 
 
 		 375 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  45.43 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  42.59 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  33.6 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  39.47 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  42.93 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  41.04 
 
 		 377 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  40.75 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  42.01 
 
 		 369 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  40.16 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  38.2 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  39.58 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  37.57 
 
 		 357 aa  242  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  37.89 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  37.47 
 
 		 427 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  37.33 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  33.24 
 
 		 376 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  34.46 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 		 376 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  35.08 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  35.98 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  33.68 
 
 		 376 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 		 376 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  32.19 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  32.98 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  31.76 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 370 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  29.57 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 388 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  30.03 
 
 		 376 aa  181  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 		 369 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  32.09 
 
 		 375 aa  179  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  36.6 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  33.42 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  33.59 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  30.05 
 
 		 382 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  31.66 
 
 		 913 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.33 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  31.66 
 
 		 913 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  31.89 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  31.66 
 
 		 913 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>