More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0261 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
357 aa  700    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  51.1 
 
 
364 aa  342  7e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  44.81 
 
 
375 aa  341  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  44.54 
 
 
375 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  41.24 
 
 
391 aa  328  9e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  42.35 
 
 
378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  40.97 
 
 
391 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  41.4 
 
 
379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  44.57 
 
 
389 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 
377 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  45.11 
 
 
389 aa  317  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  42.08 
 
 
376 aa  316  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  40.58 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  40.58 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  40.58 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  40.58 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  40.58 
 
 
376 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  44.29 
 
 
389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  43.44 
 
 
384 aa  312  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  40.97 
 
 
391 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  40.97 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  39.62 
 
 
384 aa  305  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2513  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 
381 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.865231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3707  ABC-2 type transporter  45.08 
 
 
377 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.52 
 
 
377 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 
377 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 
377 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  39.52 
 
 
377 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  39.52 
 
 
377 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  39.52 
 
 
377 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  39.52 
 
 
377 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  39.52 
 
 
377 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  39.52 
 
 
377 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  42.9 
 
 
373 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  42.9 
 
 
373 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  38.48 
 
 
379 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  39.08 
 
 
379 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  41.14 
 
 
375 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  36.81 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  38.98 
 
 
371 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  38.98 
 
 
371 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  38.27 
 
 
385 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  36.15 
 
 
378 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2392  Fis family transcriptional regulator  39.13 
 
 
387 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  36.87 
 
 
377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  39.24 
 
 
374 aa  255  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  37.26 
 
 
368 aa  255  8e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  35.11 
 
 
1106 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  35.9 
 
 
405 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  36.34 
 
 
377 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  35.71 
 
 
378 aa  246  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  35.09 
 
 
377 aa  242  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  38.04 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  38.73 
 
 
377 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  34.97 
 
 
378 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  37.06 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
378 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  34.65 
 
 
1171 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 
377 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  36.92 
 
 
377 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  37.21 
 
 
377 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  36.39 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  39.41 
 
 
375 aa  223  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  32.27 
 
 
380 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  35.86 
 
 
373 aa  208  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 
427 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
376 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  32.09 
 
 
376 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 
366 aa  202  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  32.27 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 
381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  31.84 
 
 
379 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 
380 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 
376 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 
376 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  35.07 
 
 
376 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 
378 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  34.42 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  32.47 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 
370 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 
377 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
364 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  31 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  29.6 
 
 
377 aa  176  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 
376 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.6 
 
 
369 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 
367 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 
370 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  30.03 
 
 
376 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  32.44 
 
 
369 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 
375 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 
369 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 
376 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
370 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  29.09 
 
 
374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>