More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0920 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  100 
 
 
376 aa  747    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  54.79 
 
 
376 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  56.91 
 
 
376 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  55.05 
 
 
376 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  54.79 
 
 
376 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  54.26 
 
 
376 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  53.99 
 
 
373 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  52.93 
 
 
376 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  50.53 
 
 
375 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  47.23 
 
 
377 aa  339  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  47.76 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  46.19 
 
 
378 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 
405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  43.65 
 
 
376 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  39.57 
 
 
377 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  42.13 
 
 
370 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  42.97 
 
 
377 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  43.58 
 
 
376 aa  288  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  42.67 
 
 
377 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  43.5 
 
 
377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  40.58 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  39.04 
 
 
370 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  40.86 
 
 
369 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  40.86 
 
 
369 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  38.83 
 
 
379 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  38.44 
 
 
372 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  38.77 
 
 
370 aa  275  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  43.58 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  38.5 
 
 
370 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  38.13 
 
 
369 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  38.78 
 
 
435 aa  269  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  41.31 
 
 
377 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  39.19 
 
 
370 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  39.73 
 
 
368 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  41.03 
 
 
377 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  38.98 
 
 
371 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  46.13 
 
 
364 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  39.57 
 
 
379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  40.22 
 
 
365 aa  252  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  39.63 
 
 
366 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  36.9 
 
 
369 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  38.67 
 
 
369 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  40.58 
 
 
369 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  39.25 
 
 
383 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  38.93 
 
 
383 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  38.67 
 
 
383 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  38.44 
 
 
371 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  37.85 
 
 
368 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  34.41 
 
 
369 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  34.04 
 
 
368 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  35.36 
 
 
370 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  37.6 
 
 
377 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 
366 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  39.71 
 
 
381 aa  239  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  38.92 
 
 
372 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 
369 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  38.72 
 
 
372 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 
371 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  37.17 
 
 
375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  39.2 
 
 
372 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 
368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.96 
 
 
368 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  33.96 
 
 
368 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
368 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  33.96 
 
 
368 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
368 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  33.96 
 
 
368 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  33.96 
 
 
368 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  33.96 
 
 
368 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  35.77 
 
 
378 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 
371 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 
427 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 
368 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  32.8 
 
 
378 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  34.22 
 
 
368 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 
378 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  38.51 
 
 
370 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 
368 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  33.69 
 
 
374 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  35.52 
 
 
368 aa  226  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  37.39 
 
 
373 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 
378 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
378 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  32.89 
 
 
368 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  32.89 
 
 
368 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  32.89 
 
 
368 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  32.89 
 
 
368 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  32.89 
 
 
368 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  35.2 
 
 
369 aa  222  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  35.26 
 
 
382 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  35.87 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  33.61 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 
375 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  32.71 
 
 
364 aa  216  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  34.83 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>