More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8101 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  100 
 
 
368 aa  737    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  74.25 
 
 
370 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  47.28 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  46.07 
 
 
369 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  45.68 
 
 
370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  44.41 
 
 
370 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  44.69 
 
 
371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  42.78 
 
 
374 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  43.87 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  43.87 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  43.87 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  43.87 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  43.87 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  43.87 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  43.87 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  43.87 
 
 
368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  44.14 
 
 
368 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  44.14 
 
 
368 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  44.14 
 
 
368 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  44.14 
 
 
368 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  43.87 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  43.87 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  44.14 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  43.8 
 
 
368 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  44.29 
 
 
368 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  41.71 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  41.71 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  42.58 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  42.78 
 
 
368 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  43.32 
 
 
366 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  42.49 
 
 
356 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  39.58 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  39.62 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  39.95 
 
 
365 aa  281  9e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  42.51 
 
 
372 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  40 
 
 
370 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  38.99 
 
 
378 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  40.65 
 
 
369 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  41.96 
 
 
372 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  42.23 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  42.09 
 
 
374 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  41.8 
 
 
374 aa  271  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  39.3 
 
 
384 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  37.09 
 
 
369 aa  256  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  35.03 
 
 
435 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  36.54 
 
 
371 aa  252  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  38.74 
 
 
352 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  37.77 
 
 
369 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  34.95 
 
 
373 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  37.43 
 
 
371 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  34.4 
 
 
376 aa  226  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.15 
 
 
376 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 
376 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  34.06 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  34.45 
 
 
378 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  32.78 
 
 
346 aa  205  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  34.49 
 
 
370 aa  202  7e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  38.03 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  31.91 
 
 
376 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 
375 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  32.12 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.65 
 
 
376 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 
377 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 
377 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  32.71 
 
 
377 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
371 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 
369 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.43 
 
 
369 aa  176  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 
376 aa  176  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  32.19 
 
 
376 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 
376 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  31 
 
 
383 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  31 
 
 
383 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
378 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  28 
 
 
379 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 
388 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 
379 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  28.53 
 
 
378 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.56 
 
 
384 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  31.59 
 
 
368 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  31.08 
 
 
383 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 
384 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  28.92 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 
384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  32.36 
 
 
377 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  31.99 
 
 
378 aa  165  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  30.69 
 
 
374 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.92 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  29.49 
 
 
379 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 
377 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  31.93 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>