More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0262 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  100 
 
 		 352 aa  691    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  45.4 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  42.62 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 		 370 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  42.19 
 
 		 369 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 		 370 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  38.9 
 
 		 371 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  39.73 
 
 		 374 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  42.27 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  41.99 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  41.64 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  39.07 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  37.09 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  39.32 
 
 		 356 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  38.74 
 
 		 368 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  36.44 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  36.44 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  36.44 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  36.44 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  36.44 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.16 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  36.16 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  36.16 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  36.16 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  36.16 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  36.16 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  36.16 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  36.16 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  36.19 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  37.36 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  35.99 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  37.09 
 
 		 368 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  41.71 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  36.76 
 
 		 384 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  35.9 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  34.79 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 374 aa  226  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  32.6 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  33.97 
 
 		 369 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  35.46 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  33.93 
 
 		 373 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  34.15 
 
 		 371 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  33.51 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  34.32 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  31.64 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  32.36 
 
 		 377 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 376 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  30.93 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 376 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  31.13 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 387 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.1 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 435 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.22 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.54 
 
 		 376 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  30.08 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  32.51 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  27.37 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  31.48 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 371 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 		 390 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  28.34 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 384 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  28.99 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 384 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  27.52 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  33.14 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.54 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  26.83 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  27.79 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  31.58 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 375 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 369 aa  169  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.66 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  33.43 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  32.07 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.29 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>