More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 
369 aa  733    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  62.53 
 
 
372 aa  474  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  60.6 
 
 
369 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  54.47 
 
 
371 aa  434  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  52.62 
 
 
371 aa  415  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  47.98 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  45.48 
 
 
369 aa  315  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  45.48 
 
 
369 aa  315  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  44.35 
 
 
370 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  44.77 
 
 
370 aa  297  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  43.96 
 
 
368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  41.48 
 
 
435 aa  288  8e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 
369 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.89 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  39.89 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  39.89 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  39.89 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  39.89 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  39.89 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  39.89 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  39.89 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  39.78 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  40.33 
 
 
368 aa  281  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  39.62 
 
 
368 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 
368 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 
368 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  39.34 
 
 
368 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  39.34 
 
 
368 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  39.34 
 
 
368 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  39.34 
 
 
368 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  39.34 
 
 
368 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  39.51 
 
 
374 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  38.74 
 
 
366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  41.87 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  39.22 
 
 
356 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  39.89 
 
 
371 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  39.73 
 
 
370 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  40 
 
 
369 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  37.93 
 
 
378 aa  262  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  38.2 
 
 
378 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  39.73 
 
 
370 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  40.27 
 
 
370 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  37.67 
 
 
370 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  39.14 
 
 
374 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 
368 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  38.5 
 
 
378 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  37.71 
 
 
377 aa  242  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 
384 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  35.68 
 
 
373 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  37.85 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  38.12 
 
 
372 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  37.1 
 
 
376 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  34.67 
 
 
376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  37.46 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 
376 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 
376 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  37.46 
 
 
374 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  36.83 
 
 
376 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  32.43 
 
 
376 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
377 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 
376 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 
375 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 
405 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  29.76 
 
 
378 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  35.57 
 
 
364 aa  192  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  36.39 
 
 
376 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  32.35 
 
 
379 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 
373 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  32.44 
 
 
377 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 
373 aa  186  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  30.94 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  34.13 
 
 
377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  32.43 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
379 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  31.13 
 
 
352 aa  180  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 
376 aa  178  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 
380 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
376 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 
370 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  28.23 
 
 
369 aa  176  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  32 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  32.56 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  36.44 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  34.2 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.8 
 
 
378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  30.46 
 
 
384 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 
389 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  30.65 
 
 
381 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 
383 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 
390 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
383 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
383 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 
366 aa  169  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  35.13 
 
 
389 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  31.83 
 
 
378 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  30.94 
 
 
385 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  29.37 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>