More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1477 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 371 aa  747    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  74.8 
 
 		 371 aa  587  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  55.77 
 
 		 372 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  52.32 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  52.62 
 
 		 369 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  42.7 
 
 		 371 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  43.57 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  40.05 
 
 		 368 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  38.48 
 
 		 370 aa  295  9e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  38.08 
 
 		 369 aa  292  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  38.08 
 
 		 369 aa  292  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  36.22 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  36.31 
 
 		 371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  39.18 
 
 		 370 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  37.26 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  37.81 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  38.94 
 
 		 369 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 		 370 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  35.73 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  36.44 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  35.97 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  36.54 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 368 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 368 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 		 368 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.78 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  34.78 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  35.71 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  34.78 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  34.78 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  35.71 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  35.71 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  35.71 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  34.78 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  34.78 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  35.71 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  35.07 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  33.06 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  35.28 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  33.9 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  32.44 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  35.42 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  37.01 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  35.04 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  32.35 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  34.56 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  35.1 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  35.38 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  32.16 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  31.65 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 376 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.69 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 376 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 376 aa  206  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  31.62 
 
 		 369 aa  199  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 		 369 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  30.77 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  30.24 
 
 		 377 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  32.15 
 
 		 369 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 		 377 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  28.07 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.3 
 
 		 381 aa  175  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  32.47 
 
 		 373 aa  175  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  29.54 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  27.35 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 		 380 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.77 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  29.36 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.47 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  29.27 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  27.73 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.08 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  31.48 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>