More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1295 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  100 
 
 
376 aa  735    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  75.27 
 
 
376 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  72.75 
 
 
378 aa  542  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  56.76 
 
 
377 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  47.07 
 
 
376 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  46.01 
 
 
376 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  48.53 
 
 
376 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  46.01 
 
 
376 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  46.95 
 
 
373 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  45.48 
 
 
376 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  43.01 
 
 
376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  41.6 
 
 
375 aa  291  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 
377 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  38.44 
 
 
372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  41.51 
 
 
368 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  47.47 
 
 
376 aa  272  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 
369 aa  266  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  40.32 
 
 
369 aa  266  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  40.11 
 
 
365 aa  259  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  37.37 
 
 
371 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  39.26 
 
 
379 aa  255  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  38.99 
 
 
376 aa  255  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  39.63 
 
 
370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  36.1 
 
 
369 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  44.41 
 
 
364 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  39.73 
 
 
369 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  39.43 
 
 
376 aa  249  8e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  42.74 
 
 
371 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  38.38 
 
 
370 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  37.41 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  38.81 
 
 
370 aa  239  5.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 
371 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  40.54 
 
 
381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  36.05 
 
 
368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  37.37 
 
 
369 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  38.03 
 
 
377 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  35.75 
 
 
369 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  38.89 
 
 
369 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.88 
 
 
368 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  35.88 
 
 
368 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 
368 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  35.88 
 
 
368 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  35.88 
 
 
368 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 
368 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  35.88 
 
 
368 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  35.88 
 
 
368 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
369 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  39.05 
 
 
383 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  35.62 
 
 
368 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  35 
 
 
368 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  36.87 
 
 
369 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  35 
 
 
368 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  38.52 
 
 
383 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
383 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  34.93 
 
 
370 aa  222  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  35.73 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  34.83 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  34.83 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  34.83 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  34.83 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  33.6 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  34.88 
 
 
379 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 
368 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 
378 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  35.43 
 
 
377 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
377 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 
370 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
378 aa  215  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  35.9 
 
 
378 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  34.13 
 
 
378 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 
380 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 
366 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  34.97 
 
 
372 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  34.04 
 
 
372 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 
405 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  33.24 
 
 
375 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  32.19 
 
 
378 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 
384 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  34.04 
 
 
372 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  36.97 
 
 
377 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 
368 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  31.83 
 
 
378 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  34.43 
 
 
369 aa  203  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  34.15 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  35.83 
 
 
373 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  31.75 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 
379 aa  199  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 
373 aa  195  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 
377 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  32.8 
 
 
382 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  36.31 
 
 
374 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.97 
 
 
384 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  32.2 
 
 
370 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  31 
 
 
381 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>