More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2815 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  85.56 
 
 
368 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  100 
 
 
368 aa  742    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  85.29 
 
 
368 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  85.56 
 
 
368 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
368 aa  742    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  83.7 
 
 
368 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  85.56 
 
 
368 aa  644    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  85.56 
 
 
368 aa  644    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  89.67 
 
 
368 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  85.56 
 
 
368 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  85.56 
 
 
368 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  85.56 
 
 
368 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  85.56 
 
 
368 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  83.92 
 
 
368 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  83.92 
 
 
368 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  83.92 
 
 
368 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  83.92 
 
 
368 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  83.92 
 
 
368 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  77.78 
 
 
378 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  77.25 
 
 
378 aa  595  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  78.53 
 
 
366 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  75.13 
 
 
374 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  44.66 
 
 
370 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  46.3 
 
 
370 aa  328  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  44.84 
 
 
369 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  45.48 
 
 
370 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  42.9 
 
 
374 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  44.93 
 
 
370 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  43.87 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  41.92 
 
 
371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  42.54 
 
 
356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  40.33 
 
 
369 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  40.33 
 
 
369 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  38.25 
 
 
368 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  40.98 
 
 
372 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  40.71 
 
 
372 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  40.71 
 
 
372 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  38.04 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  37.81 
 
 
369 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  39.08 
 
 
384 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  39.45 
 
 
372 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  39.51 
 
 
365 aa  280  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  41.43 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  37.87 
 
 
370 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  38.96 
 
 
369 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  37.78 
 
 
371 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  36.13 
 
 
435 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  36.6 
 
 
373 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  37.8 
 
 
371 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  35.14 
 
 
371 aa  249  6e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  33.78 
 
 
376 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  36.81 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  37.22 
 
 
378 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  33.43 
 
 
376 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  33.51 
 
 
376 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
376 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  36.65 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  37.36 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  34.83 
 
 
376 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 
376 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  34.79 
 
 
376 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 
375 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 
364 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 
376 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  32.89 
 
 
377 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
383 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
383 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 
405 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 
379 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  30.98 
 
 
383 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 
370 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 
377 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  34.93 
 
 
368 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  32.25 
 
 
369 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
381 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 
378 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.16 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  29.75 
 
 
346 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 
371 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  29.76 
 
 
377 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  29.6 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 
373 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
372 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 
373 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.61 
 
 
381 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  28.72 
 
 
379 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 
372 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 
369 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  29.45 
 
 
382 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 
368 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 
388 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 
390 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  27.41 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  28.53 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  28.53 
 
 
377 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>