More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3115 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  95.82 
 
 
383 aa  682    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
383 aa  739    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  96.08 
 
 
383 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0896  ABC-2 type transporter  64.36 
 
 
382 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  43.75 
 
 
373 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  38.54 
 
 
376 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  39.3 
 
 
375 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  37.03 
 
 
376 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  37.26 
 
 
377 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  38.5 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 
376 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  37.47 
 
 
376 aa  249  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  39.67 
 
 
368 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  34.69 
 
 
376 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  37.93 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  35.92 
 
 
376 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  35.25 
 
 
377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  35.5 
 
 
369 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  35.89 
 
 
370 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  35.69 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  35.39 
 
 
376 aa  222  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  40.97 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  35.37 
 
 
379 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  38.75 
 
 
370 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  39.25 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 
370 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  37.33 
 
 
369 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  35.54 
 
 
369 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  36.76 
 
 
377 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 
379 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 
369 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  34.23 
 
 
378 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  34.75 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  37.37 
 
 
435 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  32.64 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 
366 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  32.16 
 
 
373 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  33.96 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  34.93 
 
 
366 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  38.65 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 
368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 
368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  32.07 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  38.65 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 
377 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 
379 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 
378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 
371 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  34.46 
 
 
380 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
368 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  33.96 
 
 
371 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  30.92 
 
 
368 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  34.49 
 
 
374 aa  192  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  30.75 
 
 
368 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  30.75 
 
 
368 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  30.36 
 
 
368 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  30.75 
 
 
368 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 
367 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  30.75 
 
 
368 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30.36 
 
 
368 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 
368 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  30.36 
 
 
368 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  30.36 
 
 
368 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  30.36 
 
 
368 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 
378 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 
368 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  30.36 
 
 
368 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
369 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  30.36 
 
 
368 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 
369 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 
375 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  33.42 
 
 
378 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  34.25 
 
 
376 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 
373 aa  190  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 
378 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 
378 aa  189  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 
405 aa  189  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  27.88 
 
 
374 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  32.17 
 
 
377 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 
371 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  31.59 
 
 
372 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 
373 aa  186  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  33.42 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  27.97 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  33.9 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 
378 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  32.54 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 
368 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  29.27 
 
 
379 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  32.43 
 
 
372 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 
353 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  30.81 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 
368 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 
366 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.69 
 
 
365 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 
372 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  30.11 
 
 
370 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 
390 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>