More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2358 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  100 
 
 
376 aa  738    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  88.56 
 
 
376 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  65.07 
 
 
370 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  47.75 
 
 
379 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  44.8 
 
 
369 aa  332  6e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  44.39 
 
 
380 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  42.13 
 
 
369 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  43.85 
 
 
373 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  41.49 
 
 
377 aa  299  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  39.42 
 
 
376 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  41.07 
 
 
376 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  41.76 
 
 
366 aa  278  8e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  40.21 
 
 
377 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 
378 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  38.44 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  40.27 
 
 
376 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  39.04 
 
 
369 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  40.32 
 
 
377 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  39.73 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 
377 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 
375 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  40.16 
 
 
376 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  38.77 
 
 
376 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  39.42 
 
 
377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  39.1 
 
 
367 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  37.96 
 
 
378 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  42.44 
 
 
364 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  36.17 
 
 
371 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  36.07 
 
 
378 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  40 
 
 
381 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  38.3 
 
 
377 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  38.83 
 
 
369 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  38.83 
 
 
377 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  38.2 
 
 
373 aa  242  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  43.5 
 
 
376 aa  242  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  41.76 
 
 
370 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  39.47 
 
 
376 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  37.93 
 
 
373 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  35.54 
 
 
376 aa  236  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.23 
 
 
365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  36.7 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  38.67 
 
 
374 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  37.43 
 
 
369 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  37.77 
 
 
368 aa  232  8.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  34.31 
 
 
377 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  37.3 
 
 
366 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  35.49 
 
 
381 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  36.5 
 
 
375 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  35.28 
 
 
366 aa  229  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  36.34 
 
 
378 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  36.77 
 
 
390 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  34.31 
 
 
381 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  35.2 
 
 
378 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 
376 aa  227  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 
366 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  34.4 
 
 
379 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 
378 aa  225  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  35.96 
 
 
390 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  36.63 
 
 
378 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  34.92 
 
 
378 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  36.53 
 
 
383 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  33.87 
 
 
385 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  36.87 
 
 
371 aa  222  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  37.07 
 
 
378 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  32.63 
 
 
368 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  36.53 
 
 
383 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  35.47 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.72 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  35.73 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 
377 aa  220  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 
427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  36.41 
 
 
380 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  35 
 
 
368 aa  219  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 
372 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  35.73 
 
 
385 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 
373 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 
373 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  33.51 
 
 
382 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  35.99 
 
 
373 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  35.51 
 
 
373 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  35.51 
 
 
373 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  34.04 
 
 
369 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  35.39 
 
 
383 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 
370 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  35.51 
 
 
373 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  31.83 
 
 
388 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  35.73 
 
 
373 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  35.73 
 
 
373 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 
387 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 
370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
379 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  34.69 
 
 
372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  37.84 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  34.4 
 
 
369 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>