More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2378 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 
312 aa  612  9.999999999999999e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  46.18 
 
 
311 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
311 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
312 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  45.51 
 
 
312 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
312 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  45.83 
 
 
312 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 
312 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
312 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  40.71 
 
 
310 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.44 
 
 
312 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  39.34 
 
 
337 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  38.05 
 
 
320 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  39.23 
 
 
313 aa  238  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  41.35 
 
 
321 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  39.03 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.96 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  38.51 
 
 
316 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.77 
 
 
343 aa  228  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 
339 aa  226  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  36.57 
 
 
327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
310 aa  225  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 
316 aa  225  9e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.16 
 
 
316 aa  224  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.6 
 
 
333 aa  222  6e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  36.54 
 
 
311 aa  222  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 
324 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  35.37 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.17 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.34 
 
 
308 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  49.78 
 
 
251 aa  218  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
324 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.74 
 
 
334 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  48.61 
 
 
257 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.9 
 
 
322 aa  216  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 
324 aa  216  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 
327 aa  215  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 
323 aa  215  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.78 
 
 
327 aa  215  8e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.86 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  46.32 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.66 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  38.83 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.08 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 
330 aa  212  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 
279 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.74 
 
 
308 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 
323 aa  210  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  35.22 
 
 
303 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.67 
 
 
308 aa  208  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 
323 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.19 
 
 
325 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.01 
 
 
328 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.66 
 
 
325 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  37.06 
 
 
310 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  35.71 
 
 
309 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.48 
 
 
326 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
320 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.14 
 
 
328 aa  206  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  38.06 
 
 
310 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.69 
 
 
308 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.12 
 
 
321 aa  205  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.69 
 
 
308 aa  205  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  37.92 
 
 
282 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
329 aa  203  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.13 
 
 
279 aa  202  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.98 
 
 
325 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  35.16 
 
 
344 aa  202  8e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.6 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  36.07 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  39.61 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
308 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 
325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.61 
 
 
333 aa  199  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.9 
 
 
338 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  32.48 
 
 
319 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  35.87 
 
 
320 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  35.08 
 
 
325 aa  199  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.31 
 
 
317 aa  198  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  35.24 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.6 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  42.21 
 
 
245 aa  198  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  35.87 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  37.22 
 
 
315 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  36.42 
 
 
319 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
242 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  45.58 
 
 
245 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  36.89 
 
 
304 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  48.76 
 
 
249 aa  195  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  43.17 
 
 
240 aa  195  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  37.22 
 
 
304 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.97 
 
 
317 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  36.48 
 
 
304 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>