More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0387 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  49.18 
 
 		 251 aa  244  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  49.19 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  42.44 
 
 		 245 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  44.88 
 
 		 337 aa  202  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  43.91 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  43.3 
 
 		 311 aa  198  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  43.38 
 
 		 245 aa  198  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.46 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  41.99 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  40.83 
 
 		 320 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.76 
 
 		 312 aa  186  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 312 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  42.71 
 
 		 312 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 312 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.73 
 
 		 339 aa  185  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  41.81 
 
 		 315 aa  181  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  40.83 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.66 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 		 325 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  40 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.93 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  40.6 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  40.95 
 
 		 315 aa  178  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.4 
 
 		 328 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.65 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  40.69 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.87 
 
 		 326 aa  174  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  40.53 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  44.28 
 
 		 315 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  39.83 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.24 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.82 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2371  ABC transporter related  42.79 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0363679  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  42.93 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  40.17 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  40.35 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.47 
 
 		 316 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  40.47 
 
 		 316 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.35 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.06 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  39.42 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.01 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  36.89 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  40.18 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 330 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 325 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  38.08 
 
 		 320 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 		 333 aa  169  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  40.52 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.89 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  43 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 		 374 aa  168  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.59 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  37.44 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  40.19 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  38.5 
 
 		 309 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.97 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.04 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  38.62 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.16 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.3 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  37.34 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.44 
 
 		 360 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  40.51 
 
 		 321 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  37.76 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  41.44 
 
 		 336 aa  164  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  40.35 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  37.44 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.39 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  38.36 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  37.72 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  39.66 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.99 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>