More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2371 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2371  ABC transporter related  100 
 
 
303 aa  605  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0363679  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3386  ABC transporter related  52.48 
 
 
302 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3971  ABC transporter related  48.7 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
287 aa  222  7e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
312 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
312 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
312 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
312 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  37.18 
 
 
312 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 
312 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  37.18 
 
 
312 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  36.77 
 
 
312 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
312 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
312 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  38.26 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.82 
 
 
310 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  38.36 
 
 
337 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  40.75 
 
 
311 aa  201  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  37.03 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  44.24 
 
 
251 aa  199  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  35.65 
 
 
320 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  41.38 
 
 
250 aa  198  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  40 
 
 
321 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  39.92 
 
 
245 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 
315 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  40.08 
 
 
257 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  42.79 
 
 
249 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  37.9 
 
 
327 aa  187  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.25 
 
 
316 aa  186  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.77 
 
 
312 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  35.69 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  34.29 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.33 
 
 
312 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  40.85 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  43.98 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  34.19 
 
 
320 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  39.19 
 
 
320 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  39.37 
 
 
297 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  38.25 
 
 
334 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.08 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  36.3 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  35.55 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  36.15 
 
 
304 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  35.37 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  35.37 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  35.37 
 
 
304 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
311 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  35.48 
 
 
373 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  37.67 
 
 
314 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  36.52 
 
 
302 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  35 
 
 
319 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  40.17 
 
 
240 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  37.42 
 
 
310 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  35.31 
 
 
303 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  35.45 
 
 
308 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  36.72 
 
 
316 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  34.94 
 
 
326 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  40.62 
 
 
304 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  34.23 
 
 
305 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  35.43 
 
 
305 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  35.25 
 
 
339 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  33.02 
 
 
304 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  40.18 
 
 
320 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  36.48 
 
 
325 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  35.69 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  32.59 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
583 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  37.13 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  39.35 
 
 
308 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  34.24 
 
 
304 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  39.73 
 
 
304 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  39.73 
 
 
304 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  37.17 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  31.46 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
589 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  42.08 
 
 
593 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  35.2 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  38.14 
 
 
336 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  33.1 
 
 
305 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  39.04 
 
 
319 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  36.93 
 
 
308 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  35.2 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  35.2 
 
 
321 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  38.56 
 
 
315 aa  162  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  31.45 
 
 
315 aa  162  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  39.63 
 
 
351 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  36.07 
 
 
315 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  32.7 
 
 
307 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  36.93 
 
 
308 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  39.63 
 
 
351 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  32.27 
 
 
321 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  39.63 
 
 
304 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  39.63 
 
 
304 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  34.95 
 
 
315 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  39.63 
 
 
304 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  30.19 
 
 
308 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  39.63 
 
 
304 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  43.06 
 
 
593 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>