More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10190 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  77.42 
 
 		 310 aa  495  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  42.99 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.63 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.88 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3953  ABC transporter related  33 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00887978  normal  0.0604137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  42.25 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  37.3 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  38.75 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  32.47 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  35.76 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  39.46 
 
 		 250 aa  172  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  36.65 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  35.1 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5082  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.03 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  37.96 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  31.82 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  34.04 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  34.77 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  32.13 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  39.26 
 
 		 512 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  39.81 
 
 		 240 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  31.49 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  33.01 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  33.11 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  35.43 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.07 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.47 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  30.94 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  36.25 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  35.43 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  33.76 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  32.46 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  32.48 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  32.79 
 
 		 318 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  34.74 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  34.55 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  37.44 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  31.58 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  33.11 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.63 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  32.14 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  33.22 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  33.99 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  35.9 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  33.66 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  34.67 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  32.47 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  34.75 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  37.73 
 
 		 245 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  34.33 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  39.13 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  34.77 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  32.47 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.9 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  34.39 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  34.11 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.81 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  35.96 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  33.88 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  31.6 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  38.74 
 
 		 510 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  37.66 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  39.07 
 
 		 270 aa  160  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  31.19 
 
 		 756 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.11 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  38.57 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  34.53 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  38.68 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  34.44 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  38.22 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  36.59 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  36.59 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  32.14 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  39.62 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  36.59 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  36.59 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.58 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>