More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0606 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  100 
 
 		 321 aa  653    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  85.25 
 
 		 315 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  85.25 
 
 		 315 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  62.42 
 
 		 320 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  61.27 
 
 		 316 aa  381  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  62.95 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  62.42 
 
 		 310 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  60.71 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  62.42 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  62.54 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  62.21 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  61.56 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  61.56 
 
 		 310 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  61.56 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  61.89 
 
 		 310 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  61.24 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  60.26 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  60.77 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  61.51 
 
 		 305 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  58.88 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  61.18 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  59.31 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  60.26 
 
 		 319 aa  364  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  62.33 
 
 		 336 aa  363  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  58.94 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  59.42 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  58.09 
 
 		 304 aa  358  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  59.22 
 
 		 314 aa  358  8e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  60.91 
 
 		 310 aa  358  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  61.31 
 
 		 319 aa  358  9e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  58.14 
 
 		 320 aa  357  9.999999999999999e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  58.9 
 
 		 326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  59.24 
 
 		 312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  59.24 
 
 		 312 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  59.24 
 
 		 312 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  58.58 
 
 		 311 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  58.92 
 
 		 312 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0573  ABC transporter ATP-binding protein  59.41 
 
 		 307 aa  354  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  60 
 
 		 308 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  59.6 
 
 		 307 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  58.77 
 
 		 312 aa  352  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  57 
 
 		 325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  60.13 
 
 		 304 aa  352  7e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  60.13 
 
 		 304 aa  352  7e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 312 aa  351  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  59.54 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.503646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  59.87 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  59.87 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  59.87 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  59.87 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  349  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  57.19 
 
 		 312 aa  348  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  57.51 
 
 		 312 aa  348  8e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  57.19 
 
 		 312 aa  348  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  57.19 
 
 		 312 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  59.87 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  59.87 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  57.43 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  59.6 
 
 		 307 aa  345  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  58.84 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  56.77 
 
 		 304 aa  341  8e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  56.77 
 
 		 304 aa  341  8e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1017  ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 306 aa  341  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 		 305 aa  340  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  57.95 
 
 		 307 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0848  ABC-type multidrug transport system, ATP-binding protein  56.19 
 
 		 309 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.652188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  57.05 
 
 		 306 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3880  ABC transporter related  54.1 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555039  normal  0.729872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02791  ABC transporter ATP-binding protein  53.25 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0560  ABC transporter ATP-binding protein  53.16 
 
 		 310 aa  311  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0496  ABC transporter related  53.16 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0799  ABC transporter related protein  45.25 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0640073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  40.67 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  42.26 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  41.42 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  41.77 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  41.42 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 262 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  42.14 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  41.07 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  39.94 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  48.54 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 		 309 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  42.3 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5043  ABC transporter related  41.18 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  38.96 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  41.18 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  40.26 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5174  ABC transporter related  41.08 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>