More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5800 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  55.82 
 
 		 250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  49.18 
 
 		 249 aa  244  6.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  45.83 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  44.86 
 
 		 245 aa  218  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.78 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  45.65 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  44.59 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  42.53 
 
 		 321 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  40.16 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 312 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 312 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 312 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 320 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.98 
 
 		 312 aa  195  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 311 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  40.99 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  37.94 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 311 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  42.15 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  43.36 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.26 
 
 		 316 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3971  ABC transporter related  40.91 
 
 		 306 aa  185  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  40.72 
 
 		 337 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  40.5 
 
 		 330 aa  184  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  40.72 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  40.64 
 
 		 593 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2371  ABC transporter related  44.24 
 
 		 303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0363679  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 309 aa  181  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  40.09 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  40.09 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  39.06 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  42.06 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  42.59 
 
 		 336 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  39.37 
 
 		 593 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 		 339 aa  178  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  38.84 
 
 		 339 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.35 
 
 		 334 aa  178  8e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  41.96 
 
 		 338 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.71 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  40.36 
 
 		 339 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  39.24 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  41.7 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  38.14 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  42.34 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.15 
 
 		 328 aa  175  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  38.33 
 
 		 339 aa  175  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  35.89 
 
 		 583 aa  175  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  41.7 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.83 
 
 		 328 aa  174  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 		 327 aa  174  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  39.08 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  38.86 
 
 		 512 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.19 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 		 312 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  38.4 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  40.54 
 
 		 335 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  39.82 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  42.48 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  39.64 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  38.77 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  42.66 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.44 
 
 		 309 aa  171  7.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  33.75 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  40.54 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3386  ABC transporter related  41.23 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.57 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  38.57 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  37.5 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  40 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 		 351 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  39.53 
 
 		 599 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>