More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3971 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3971  ABC transporter related  100 
 
 		 306 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3386  ABC transporter related  62.09 
 
 		 302 aa  349  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2371  ABC transporter related  48.7 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0363679  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  35.57 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  38.75 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  34.73 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  35.96 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  33.23 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  33.43 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  32.24 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  41.52 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.91 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  37.7 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  40.91 
 
 		 251 aa  185  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  36.98 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  36.48 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  36.99 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.37 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  35.37 
 
 		 315 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  40.09 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.17 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.55 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  38.98 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  41.51 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  37.19 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  36.36 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  34.09 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  37.63 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  35.49 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1225  ABC transporter related  36.67 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  32.33 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 589 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  36.97 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  32.58 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  32.48 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  32.26 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  32.35 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  35.59 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  34.81 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  35.67 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  32.35 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  33.56 
 
 		 309 aa  158  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  32.09 
 
 		 293 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  38.89 
 
 		 593 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  39.82 
 
 		 593 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.95 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  37.02 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  35.79 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  33.78 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  39.23 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  34.64 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  34.78 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.42 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.24 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  31.51 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.74 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  35.07 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 583 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.11 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.53 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  29.61 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  36.77 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  34.81 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  33.85 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  32.14 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  34.97 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.32 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  35.1 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  34.81 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  36.45 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  31.82 
 
 		 373 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  32.87 
 
 		 344 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  31.73 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  31.73 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  31.41 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.67 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  40.36 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  39.38 
 
 		 599 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0387  ABC transporter, ATP-binding protein; GldA-related gliding motility protein  35.87 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.225863  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  34.38 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  36.28 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.89 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  36.67 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  41.71 
 
 		 588 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  34.16 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  34.16 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  33.44 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>